Prima puntata della stagione. Circa tre mesi dopo gli eventi del finale dell’ultima stagione, la U.S.S. Cerritos si imbatte in “strane energie” durante una missione.

L’equipaggio dei ponti inferiori ha difficoltà a fare amicizia con il guardiamarina Jet Manhaver, a cui sono state assegnate la cuccetta e le mansioni di Boimler. Nel frattempo, la vita di Boimler sulla U.S.S. Titan è molto più intensa di quanto immaginasse.

La dottoressa T’Ana assegna una missione speciale a Tendi, che chiede a Mariner di aiutarla. Sulla U.S.S. Cerritos, Rutherford è ossessionato da un mistero che coinvolge la plancia.

La U.S.S. Cerritos è inviata su un pianeta per indagare sull’avvistamento inspiegabile di un pericoloso mugato.

Mariner e Boimler cercano di scoprire dove si terrà una leggendaria festa della Flotta, mentre gli ufficiali della plancia devono gestire un diplomatico alieno piuttosto insicuro.

Il consolidamento delle anomalie genera emozioni contrastanti tra l’equipaggio dei ponti inferiori. Nel frattempo, il capitano Freeman tenta un negoziato di pace nel pianeta dei Pakled.

Mariner e Boimler si ritrovano su un pianeta disabitato con un computer senziente. Sulla Cerritos, il tenente Billups deve dimostrare le sue competenze da ingegnere a una vecchia avversaria.

Una consulente arriva sulla U.S.S. Cerritos per fare esercitazioni che richiedono uno scambio di incarichi tra la plancia e i ponti inferiori.

Mentre l’equipaggio della U.S.S. Cerritos si gode una pausa durante un lungo viaggio a curvatura, Boimler cerca di farsi un amico tra gli ufficiali della plancia.

Nel finale di stagione, la U.S.S. Cerritos è incaricata di aiutare una nave classe Excelsior in una missione di primo contatto.