魔法光源股份有限公司

在這個世界上，魔法少女是終極夢想職業，她們負責消滅名為“怪異”的危險生物。大學生櫻木花奈因找不到工作而喪失信心。有一天，她遭遇“怪異”的攻擊。魔法少女越谷仁美飛來救援，但她面臨的敵人比她預想中還要強大。她尋求幫助時，花奈挺身而出……

在幫助越谷後，花奈決定加入魔法光源魔法少女公司。社長重本浩司、工程師二子山和央及翠川楓在銷售方面至少可以說是獨一無二的高手，花奈大吃一驚。也許如此衝動地加入公司是一個錯誤！翠川鼓勵​​她嘗試騎掃帚。隨後他們收到了消滅變異的請求……

花奈加入魔法少女公司一個月後，她和越谷仁美正忙著消滅“怪異”，魔法少女土刃芽衣也加入戰鬥，瞬間消滅了獵物。後來，因一項消滅請求，大家一起討論解決方案。重本批評她的想法不符合公司美學，花奈感到困惑。“怪異”也變得更加活躍……

為了保護歷史悠久的商店街，花奈建議使用一種新型魔法，但這只是紙上談兵而已。重本批准使用這種魔法，魔法工程師二子山立即採取行動，火速將其變為現實。花奈和越谷在現場分頭對付敵人。就在她們各自感到手足無措時，最初的魔法光源魔法終於完成了！

重本下達指令，魔法光源的成員們一起唱卡拉OK。除翠川之外，所有人都在唱歌，他們各自展現了自己的個性！聯誼會取得巨大成功。第二天，重本的老朋友、大型化妝品製造商美彌子堂的社長麻生美彌子打來電話。花奈最後被分配到美彌子堂魔法少女部幫忙一週。

在美彌子堂的第一天，花奈與魔法少女葵莉莉搭檔。她們本來應該一起工作的……但莉莉卻帶花奈去購物！這很有趣，但莉莉的自由精神卻讓花奈有點不知所措。莉莉讚美她們共同的職業，這讓花奈意識到魔法少女可以是千姿百態的。然後兩人前往阿博瑞克飯店進行例行的“怪異”檢查……

花奈和莉莉發現自己陷入了困境，因為她們遭到變異“怪異”的攻擊。來自AST公司的芽衣帶後援抵達。在她的命令下，花奈和莉莉出發去疏散路人，芽衣開始獨自與“怪異”戰鬥。一場激烈的戰鬥隨之而來。由於擔心芽衣，花奈回到了現場。花奈發現芽衣受傷了，主動提出與她並肩作戰……

歡迎來到一年一度的魔法科技博覽會，這裡展示新的魔法工具和技術。在博覽會上，一些著名的魔法工程師接近魔法光源的成員時，沉默寡言的二子山結結巴巴說不出話來。看來商店街事件中所發動的魔法已成為人們熱議的話題！在觀看對付變異“怪異”的魔法演示時，現場出現了一個人！

三年前，二子山還是大學生，他是魔法愛好者。他的痴迷程度令人出乎意料，但他對批評的恐懼讓他幾乎放棄在魔法行業的工作。隨後，他接到一通電話！現在，在魔法科技博覽會上，二子山在開發魔法來對付變異“怪異”，但他的電腦漸漸變得慢吞吞。於是他向身邊的工程師求助……

花奈和越谷拜訪了花銀次，她曾經創造了魔法光源所使用的掃帚。他們要求花調整掃帚的規格，但她說會創造一款新掃帚！與此同時，魔法光源公司在博覽會上工作的影片被傳到網路上，隨即成為新聞焦點。重本透露他計畫，他要趁熱打鐵擴大自己的業務，將魔法光源的技術和專有技術出售給其他公司。

花奈被指派去訓練從阿普達借調到魔法光源的魔法少女牧野茜。第一天，小茜真是咄咄逼人，花奈大吃一驚。但後來她意識到小茜對自己的工作有多認真，兩人之間的隔閡逐漸縮小。花奈、越谷和小茜一起被派去工作時，花奈的角色不是跟越谷搭檔，而是支援她的練習生……

花奈和小茜所在的廢棄公寓裡，一隻巨大的變異“怪異”把她倆包圍在火焰中。重本等人競相尋找解決問題的辦法，但缺乏敵人的相關資料……花奈和小茜試圖與越谷會合，但火焰逼近她們。隨後花奈想起重本曾經對她說的話，她召集大家再次挑戰“怪異”！