NCIS

In de eerste aflevering van seizoen 13 vecht Gibbs voor zijn leven aan boord van een marinehospitaalschip na te zijn neergeschoten, terwijl DiNozzo en Joanna Teague naar Shanghai reizen om te proberen de Calling te stoppen.

Gibbs roept het team op om DEA-agent Luis Mitchell (John Gabriel) bij te staan bij een koude zaak, maar DiNozzo ontdekt dat er meer is tussen Gibbs en de agent en zijn wens om hem te helpen. Verder roddelt het team over de nieuwe look van Gibbs. Hij verruilt zijn standaard militaire coupe en poloshirt voor een vlot kapsel en een maatoverhemd.

Als een marinier in Quantico wordt vermoord nadat hij Gibbs had gebeld om over een ​​mogelijke zaak te praten, gaan Bishop en McGee vermomd als echtpaar een luitenant ter zee en diens vrouw in de gaten houden.

Vance keert samen met Gibbs terug naar actieve dienst als een moordzaak verband blijkt te houden met een voormalig NCIS-agent die hij ooit heeft opgesloten wegens het stelen van bewijs.

Bij het bezoek aan een farmaceutisch laboratorium vanwege een moordzaak, komt Abby zonder communicatie met de buitenwereld te zitten als gewapende mannen het gebouw in gijzeling nemen.

Wanneer een onderofficier wordt vermoord volgens de werkwijze van een lokale seriemoordenaar, moet het NCIS-team bepalen of dit het nieuwste slachtoffer van de moordenaar is of het werk van een copycat. Verder moeten McGee en Delilah compromissen leren sluiten voordat zij gaan samenwonen.

Het NCIS-onderzoek naar een vermoorde gepensioneerde marinecommandant verplicht Ducky zijn lidmaatschap te onthullen van een geheim genootschap dat koude zaken oplost.

DiNozzo wordt herenigd met zijn ex-vriendin Jeanne Benoit als opstandelingen in Soedan een groep vrijwillige artsen aanvallen, onder wie zich haar man bevindt. DiNozzo en McGee reizen naar de plaats delict voor de moord- en ontvoeringszaak en gaan mee op zoek naar de vermiste artsen.

Om zijn naam te zuiveren verschijnt een onderofficier vrijwillig voor de krijgsraad, mits NCIS zijn wegens een procedurefout verworpen moordzaak in behandeling neemt. Verder bespreken Bishop en Jake hun huwelijksproblemen.

In de hoop een grotere familietragedie te voorkomen, vraagt de staatssecretaris voor de marine het NCIS-team om een matroos met leukemie te helpen een beenmergdonor te vinden. Eerder waren diens twee broers namelijk al gesneuveld. Bovendien keert Bishop voor Thanksgiving terug naar huis in Oklahoma.

Nadat Ducky is aangevallen door een man die beweert dat hij informatie heeft over diens tientallen jaren geleden overleden halfbroer, gaat het NCIS-team op zoek naar de dader terwijl Ducky terugdenkt aan de laatste emotionele dagen met zijn broer. Met de vakantie in zicht bespreken Bishop en Jake (Jamie Bamber) de toekomst van hun relatie.

Als passagiers en bemanning in een privé-vliegtuig onderweg van New Orleans naar Washington D.C. dodelijk worden vergiftigd, wijzen alle bewijzen naar de vermiste kok: Abby's broer Luca (Tyler Ritter). In het eerste deel van een dubbele aflevering werken Gibbs en het D.C.-team samen met Pride en met New Orleans om Luca te vinden en uit te zoeken waarom een particulier bedrijf het doelwit was.

Tijdens het onderzoek naar de moord op een matroos die voor een jury moest getuigen, ontdekt het NCIS-team de heropleving van een internationaal netwerk voor mensenhandel. En McGee hoopt de nacht bij een collega thuis door te brengen, nadat door onweer de stroom in de stad is uitgevallen.

Wanneer een diepzeeduiker tijdens zijn werk wordt vermoord, moeten zijn stoffelijk overschot en verdachte medewerkers vier dagen in een high-tech decompressiekamer blijven, waardoor het NCIS-team een ​​onorthodox onderzoek van buiten de tank kan uitvoeren.

Wanneer de staatssecretaris voor de marine, Sarah Porter (Leslie Hope), erachter komt dat haar dochter is ontvoerd, gaat het NCIS-team samen met de FBI op onderzoek uit om een motief vast te stellen en haar thuis te brengen. Ook is McGees jeugdvriendin, NCIS-agent Valerie Page (Christina Chang), in de stad om het team te helpen met een uitgebreide training in tactieken.

Dokter Cyril Taft (Jon Cryer) ervaart de spanning van een NCIS-zaak als hij Gibbs verdachte moet opereren en belangrijk bewijs vindt. Verder bezoekt Dinozzo Jeanne Benoit (Scottie Thompson) voor zijn onderzoek naar de artsen in Soedan.

De persoonlijke plannen van de NCIS-agenten moeten wachten wanneer elk van hen fouten tegenkomt in een schijnbaar duidelijk afgesloten zaak. Ook kibbelen McGee en Delilah (Margo Harshman) over het feit dat ze tijdens het eten niet over werk mogen praten, terwijl DiNozzo zijn date verveelt met praten over zijn werk.

Het NCIS-team onderzoekt opnieuw de overval op een groep scherpschutters, nadat een Amerikaans echtpaar een half jaar later in hetzelfde gebied wordt aangevallen. In deze 300e aflevering van NCIS ontdekt Gibbs dat hij het account van de enige overlevende, Aaron Davis (Taye Diggs), nodig heeft. Hij probeert contact te krijgen met de gewonde soldaat die voor PTSS in het ziekenhuis wordt behandeld.

Het NCIS-team moet vaststellen wie liegt: de echtgenote of de minnares. Deze vrouwen beschuldigen elkaar van de moord op een officier van de voorlichtingsdienst. Verder helpt Anthony DiNozzo senior (Robert Wagner) een dakloze vrouw die gelooft dat hij haar vader is.

Nadat Tony's identiteit door meerdere daders is gestolen, beginnen de nep-DiNozzo's senatoren te chanteren.

Gibbs en FBI-agent T.C. Fornell (Joe Spano) werken samen als twee Britse gevangenen, onder wie een voormalig spion, ontsnappen en in een zeecontainer in de VS arriveren. Verder is McGee op huizenjacht en hij is vastbesloten uit te zoeken hoe DiNozzo zijn luxueuze woning heeft gekocht.

Wanneer een 14-jarige een inbraak in huis verijdelt, vermoedt Gibbs dat de tiener relevante gegevens achterhoudt. Verder reizen directeur Vance en FBI-agent Fornell naar Londen als onderdeel van de lopende zaak rondom de ontsnapte Britse spionnen.

Het NCIS-team houdt met de FBI en MI6 een internationale klopjacht op een ontsnapte Britse spion door wiens toedoen een collega op de intensive care voor zijn leven vecht.

In de slotaflevering van seizoen 13 zetten NCIS, FBI en MI6 de internationale klopjacht voort op een ontsnapte Britse spion, die het op huidige en voormalige agenten gemunt heeft.