Après avoir résolu un ancien problème mathématique caché dans un jeu vidéo, le jeune Eli Wallace est recruté par le docteur Nicholas Rush afin de collaborer à un mystérieux projet nommé "Porte des Étoiles", sur la base spatiale Icare. Mais une attaque surprise ne leur laisse plus le choix : il faut ouvrir une nouvelle porte menant aux confins de l'univers !
