Sentindo-se um pouco entediados com suas novas vidas de heróis, Po e as crianças estão animados para aceitar um convite importante à Cidade Proibida. Enquanto isso, há uma curiosa perturbação no fundo da Vila dos Pandas...

Po e as crianças tomam um atalho para o barco a caminho da Cidade Proibida, e são desviados por um macaco sorrateiro. Zhizhu informa ao prefeito Li sobre alguns sons perturbadores vindo da Nascente.

Quando Po e, eventualmente as crianças, finalmente conseguem chegar ao barco, eles descobrem velhos amigos, novos inimigos, e uma carga muito curiosa.

Po e as crianças são mais uma vez desviados, dessa vez por Toupeiras que escolheram Bao para ser seu deus. Mas quando Bao não consegue derrotar a criatura mítica que assola o deserto, Fan Tong se envolve para salvar o dia.

Po e as crianças finalmente chegam à Cidade Proibida. Depois de uma tentativa de assassinato, Xiao alista Po e as Quatro Constelações para ajudar a protegê-la durante o funeral de seu pai.

Po e as crianãs concordam em escoltar um carregamento de alimentos em um dirigível para uma região da China assolada pela seca. Mas Nu Hai tem algumas suspeitas sobre Shi Long, que ela descobre não estarem erradas quando percebe que o dirigível está marcado para explodir... com eles a bordo!

Po e as crianças conseguem chegar à Cidade de Gongmen, em busca do contato que eles descobriram que tem informações sobre a queda do dirigível. Enquanto isso, Xiao, de luto pela presumida morte de seus novos amigos panda, foge para a floresta e encontra uma nova amiga.

Em uma enorme batalha marinha, Po e as crianças consequem escapar da perseguição da polícia e chegam à Ilha Vulcânica em busca de respostas. A Imperatriz Xiao começa a aprender como se defender.

Na Ilha Vulcânica, Po e as crianças são reunidos com Li, Vovó, Ping, o Galo, Wing e Wong, e trabalham juntos para descobrir o que está acontecendo na ilha. Xiao começa a suspeitar de seus funcionários reais.

O grupo todo escapa da perseguição dos guardas, lutam contra a lava flúida, e sobrevivem ao desmoronamento de cavernas e pilares, e finalmente retornam à Cidade Proibida. Xiao está pronta para fugir do palácio, mas Shi Long tem outros planos para ela.

O grupo descobre sobre forças muito maiores e mais nefastas trabalhando contra a Imperatriz e o Reino da China, e precisam criar um plano para pôr um fim nisso, antes que seja tarde demais.

Quando as coisas não funcionam de acordo com o plano, Po e as crianças precisam se unir a outros aliados para salvar a Imperatriz e proteger a China.

Po e as crianças passam pelo feste final, e precisam usar todo o seu conhecimento e habilidades para derrotar a Demônia Branca de Osso.