Bones

Brennan et Booth enquêtent sur une communauté soupçonnée d'avoir des tendances cannibales. Pendant ce temps, Angela embauche un détective privé pour retrouver son ex et annuler son mariage.

Lorsqu'une mère de famille est tuée dans une explosion de minivan, Brennan et Booth partent enquêter.

Une enquête sur un corps mutilé retrouvé dans une forêt mène l'équipe vers un groupe sadomasochiste secret. Pendant ce temps, Angela décide de faire de l'hypnose pour tenter de se souvenir du nom de son mari, pour qu'elle puisse obtenir un divorce.

Le corps d'un fermier est retrouvé : les premiers soupçons se portent aussitôt sur les autres fermiers qu'il tentait d'expulser de leurs terres. Mais c'est sans prendre en compte la vie adultère qu'il menait parallèlement.

Une momie est découverte par un enfant nue dans un labyrinthe le jour d'Halloween. Booth et Brennan se rendent compte au fil de leurs recherches qu'il s'agit d'une victime d'un serial killer.

Lorsque le corps d'une interne de l'institut Jefferson est retrouvé dans l'incinérateur du bâtiment, la découverte mène à des soupçons au sein de l'institut. Pendant ce temps, Cam demande à Booth de se faire passer pour son petit ami lors d'une réunion de famille.

Une capsule « témoin », devant servir de document historique, enterrée par la promotion 1987 d'un lycée est déterrée par un groupe d'anciens élèves. Ceux-ci sont très choqués lorsqu'ils trouvent à l'intérieur le corps d'un ancien camarade. Booth et Brennan découvrent que la victime était un élève isolé, aussi décident-ils de fouiller dans le passé de la victime.

Lorsque des ouvriers du bâtiment découvrent le corps d'un archevêque dont les rotules ont été retirées chirurgiquement, l'équipe se repenche sur le dossier du Fils de la veuve. Lorsqu'Angela découvre une carte des victimes dans les preuves, l'équipe réalise que le tueur emploie une méthode systématique pour sélectionner ses victimes. Avec tout d'abord un musicien et un archevêque, l'équipe...

Brennan et Booth enquêtent sur la mort d'un Père Noël, tandis que Bones tente d'offrir à son père le Noël dont il a toujours rêvé. Booth accepte de ne pas passer les fêtes avec Parker.

Un jeune couple trouve les restes d'un squelette dans la boue de sources thermales.

Un joueur de basketball universitaire est retrouvé mort sous les gradins du terrain.

Un bébé est retrouvé sur la scène du meurtre de sa mère. Tandis que l'équipe de l'institut Jefferson enquête, Brennan, qui n'a rien d'une mère, s'occupe de l'enfant.

L'équipe de l'institut Jefferson essaie tant bien que mal de rester impartiale lorsqu'ils sont tous appelés à témoigner lors du procès du père de Brennan, qui pourrait être condamné à mort pour le meurtre du directeur adjoint du FBI, Kirby.

Lorsque le cadavre d'un chanteur en herbe (Ace Young, d'American Idol), est découvert, Booth et Brennan se rendent à une soirée "micro ouvert" où ils rencontrent les amis, les rivaux, et une fan particulièrement obsédée du défunt.

Dans le dernier épisode de la troisième saison, l'arrivée d'une mâchoire humaine à l'institut Jefferson semble être l'œuvre de Gormogon, tandis que la disparition du squelette argenté du labo suggère qu'un membre de l'équipe pourrait bien servir d'apprenti au tueur en série.