The Irregular at Magic Highschool

Der Jahreswechsel beginnt und zum neuen Jahr soll Shizuku für drei Monate ins Ausland für einen Schüleraustausch. Die Austauschschülerin ist Angelina Kudou Shields, die als Angie Sirius und somit Head-Commander einer Magier-Organisation des US-Militärs - den Stars - nach Japan geschickt wird, um Tatsuya zu beschatten.

In einem Park in West-Shibuya konfrontieren zwei „Hunter" Einheiten Demo Second, einen Deserteur der USNA. Dieser greift mit einem Komplizen Menschen an und saugt deren Energie aus. Während Demos den zwei Hunter Einheiten und sogar Angie Sirius entkommt, kämpft sein Komplize mit Leo, der gerade einen nächtlichen Spaziergang macht. Darauf hin landet Leo im Krankenhaus.

Tatsuya sucht sich Rat bei seinem Meister Yakumo und versucht ein Mittel gegen einen Zauber zu finden, den Angie Sirius benutzt, um ihr Äußeres zu verschleiern. Erika und Mikihiko sind Nachts auf Streife und konfrontieren den Angreifer von Leo, sowie Angie, die gerade dabei ist, den Parasit zu verfolgen. Ihr Trupp war kurz davor hinter Demos Second her, den Angie erschießen konnte.

Tatsuya kämpft gegen Lina und als er in der Unterzahl ist, tauchen Yakumo und Miyuki auf, um sich einzumischen. Tatsuya und Lina vereinbaren einen Zweikampf: Sollte Tatsuya gewinnen muss Lina ihm alle Fragen, die er hat offen beantworten. Miyuki, die Lina nicht verzeihen kann, dass Lina Tatsuya versuchen wollte umzubringen, stellt sich dazwischen.

Mayumi, Katsuto, Mikihiko und Erika haben sich zusammengeschlossen und nehmen die Verfolgung der Parasiten auf. Mayumi fühlt sich von Tatsuya ausgenutzt und plant eine Rache für Valentinstag. Tatsuya und Miyuki werden abends von Shizuku angerufen, die betrunken versucht die zuvor erhaltenen Informationen weiterzutragen.

Colonel Balance hält einen Pepptalk mit Lina und sichert ihr eine höhere Unterstützung vor Ort für ihre Mission zu, nachdem Sylvie zurück nach den USNA beordert wurde. Tatsuya trainiert die Technik „Weitschlag", die es ihm ermöglichen soll, spirituelle Wesen direkten Schaden zufügen zu können. Kurz darauf wird in den Nachrichten offen über die Existenz der „Dämonen" berichtet.

Lina wird von Colonel Balance dazu aufgefordert die Verfolgung und Zerstörung der Deserteure abzubrechen und sich sofort wieder der Festnahme des strategischen Magiers zu widmen. Dazu werden ihr Einheiten von Stardust zur Verfügung gestellt. Tatsuya und die Anderen finden derweil heraus, dass der Parasit sich in einem humanoiden Roboter namens Pixie eingenistet hat.

Miyuki will nicht, dass Tatsuya erfährt, dass Sie fähiger ist, als Sie vorgibt zu sein. Wenn er in dem Glauben wäre, dass Sie als potentielle Anführerin der Yotsubas allein zurechtkommen würde, wird er sich von ihr abwenden. Sie soll auch bald verheiratet werden und Kinder in die Welt setzen, doch Miyuki versucht diesen Moment hinauszuzögern, weil Sie nur ihrem Bruder zur Seite stehen will.

Tatsuya, Miyuki, Honoka und Pixie haben drei Parasiten überwältigt. Mikihiko, Erika und Leo verspäten sich, sollen dann aber für den Transport der Parasiten verantwortlich sein, während Tatsuya und die anderen sich um Honoka kümmern, die vom Einsatz einer Psychokinese durch Pixie geschwächt ist. Tatsuya glaubt, dass der Haarschmuck von Honoka etwas damit zu tun hat.

Tatsuya und die anderen treffen sich auf dem Übungsgelände hinter der ersten Oberschule und treffen dort auf die Parasiten, doch Lina ist auch mit von der Partie und will ihre Mission um jeden Preis erfüllen. Tatsuya, der versucht, die Parasiten erst zu versiegeln, damit sie nicht ihren Wirt verlassen können, wird mit Lina konfrontiert, die ohne Verstand jeden Parasiten nacheinander tötet.

Lina realisiert, dass sie den Titel Sirius durchaus ablegen könnte, da es doch stärkere Magier als sie gibt. Es vergeht einige Zeit und die Abschlussfeier steht an. Tatsuya erinnert sich daran, dass die zwei Parasiten, die sie versiegeln konnten, verschwunden sind und fragt sich, ob diejenigen, die dahinterstecken, jetzt ihr eigentliches Ziel damit erreicht haben.

Ayako und Fumiya haben den Auftrag Informationen über eine terroristische Gruppe zu bekommen und dafür müssen sie sich während der Einweihungsfeier des Offshore Towers in Tokyo auf die Lauer legen und ein paar Terroristen gefangen nehmen. Tatsuya und Miyuki wurden von Shizuku zu dieser Feier eingeladen und auch Honoka ist anwesend.

Die Front der Neuen Menschheit hat sich im Verwaltungszentrum des Tokyo Offshore Towers verschanzt und droht damit, dass Gebäude in die Luft zu sprengen. Die Gäste der Feier haben eine Stunde Zeit, um das Gebäude zu evakuieren, aber als ein Erdbeben die Fahrstühle zum Stoppen zwingt, versuchen Tatsuya, Miyuki und Minami mit ihnen zu verhandeln.