Le traitement proposé par Shaun pour un patient sans abri le place, lui et Jared, dans la ligne de mire d'Andrews. De son côté, Claire essaie de convaincre Melendez de pratiquer une opération cardiaque risquée pendant que Glassman doit surmonter ses sentiments envers son oncologue, le Dr Marina Blaize.

Alors que Shaun écarte le Dr Melendez pour soigner un homme de ménage gravement malade et s'occuper du retour de Lea, le Dr Lim risque une poursuite judiciaire en aidant une adolescente à réparer les dommages causés par une coutume archaïque.

Les docteurs Melendez, Brown et Park demandent à de jeunes mariés de choisir entre sauver la vie de la femme et leur capacité future de fonder une famille. Pendant ce temps, le Dr Lim, qui doit s’occuper de certaines affaires personnelles, laisse la supervision de la salle des urgences à Shaun et Reznick.

Shaun se sert de son passé pour aider une adolescente déficiente intellectuelle à se séparer de sa mère, tandis que Claire se retrouve entre une jeune grimpeuse blessée et ses parents inquiets.

Quand un patient souffrant d’anorexie ne parvient pas au poids nécessaire pour survivre à une opération cardiaque, Claire suggère de réaliser une opération expérimentale à laquelle Melendez est fermement opposé. Pendant ce temps, Shaun et Lea changent les termes de leur relation actuelle.

Morgan et Shaun doivent statuer sur la façon de traiter une jeune violoniste qui se rend aux urgences avec un doigt infecté. Pendant ce temps, Lim, Claire et Park ne savent pas si leur jeune patient est vraiment malade ou cherche à attirer l’attention.

Shaun et Morgan ont affaire à deux frères qui s'affrontent en négociant le don d'un rein contre l'avenir de l'entreprise familiale. Pendant ce temps, une amie de Claire en phase terminale du cancer lui demande quelque chose qu’elle ne pense pas pouvoir lui donner.

Une patiente de Shaun se voit obligée de révéler un secret à son mari à cause du traitement qu'il lui a administrée. Neil, Morgan et Alex ont affaire à un patient dont les parents ne croient pas en la vaccination.

Les docteurs Melendez, Reznick et Brown s’efforcent de réaliser le souhait d’un patient qui veut subir une opération visant à supprimer ses pulsions pédophiles. De son côté, Shaun reçoit une leçon d'empathie.

Shaun et Alex s'occupent de deux patients dont les symptômes laissent présager une infection susceptible de se transmettre par l'air. Le personnel s'emploie à maîtriser l'infection avant qu'elle ne se propage au reste des patients aux urgences, ce qui entraîne la mise en quarantaine de l'hôpital.

Durant la quarantaine, Shaun se sent submergé par le chaos et le bruit dans la salle des urgences. Le Dr Reznick se bat pour garder ses patients en vie.

Au lendemain de la quarantaine, le personnel tente de reprendre une vie normale. Alors qu'Audrey se remet tout doucement, elle doit également gérer sa nouvelle relation avec Neil.

Les docteurs Murphy, Reznick et Lim traitent une femme atteinte d'autisme et souffrant d'une maladie cérébrale délicate. En parallèle, Lea et Shaun essayent de trouver leur équilibre en tant que colocataires.

Le Dr Andrews tente de convaincre une famille en deuil de faire don du visage de sa fille à une autre jeune fille qui a été défigurée dans un accident.

Le manque de tact de Shaun vis-à-vis d'une mère dont le nouveau-né est gravement malade, amène le nouveau chef du service de chirurgie à s'interroger sur le statut de résident de Shaun.

Le nouveau chef du service de chirurgie, le Dr Jackson Han, considère que Shaun est un handicap et fait tout pour l'éloigner définitivement du bloc opératoire.

Shaun regrette de ne pas participer à une intervention risquée impliquant le retrait de la tumeur d’un patient. Ecarté du service de chirurgie par le Dr Han, il doit utiliser ses talents pour déterminer la cause des blessures d’un nourrisson.

Une bagarre dans un bar envoie Shaun à l'hôpital Saint-Bonaventure. De leur côté, Dr. Melendez et Dr. Lim rendent publique leur liaison.