Tras destruir la máquina del tiempo, Rintaro Okabe intenta vivir con normalidad, pero Suzuha insiste en que debe evitar la Tercera Guerra Mundial. Al conocer a Maho, una científica que trabaja en la IA Amadeus, se ve atrapado en una lucha que abarca pasado, presente y futuro. ¿Logrará alcanzar una línea temporal donde todos puedan sobrevivir y reencontrarse al fin?
