Três Espiãs Demais!

É tempo de formatura no Colégio Beverly Hills, mas quando a cerimônia começa, toda a turma da formatura, incluindo Sam, Clover e Alex, misteriosamente desmaiam.

Sam, Clover e Alex chegam à Universidade de Malibu, uma faculdade com uma linda vista para o Oceano Pacífico, e então elas se preparam para iniciar sua carreira universitária. No entanto, porque se registraram no último minuto, se encontram num dilema de habitação. Embora Clover e Alex foram colocadas em um mesmo quarto, Sam está sendo temporariamente alojada com uma companheira de quarto.

Jerry diz as meninas que elas terão uma missão muito perigosa à vista: transportar um bandido extremamente perigoso da penitenciária de alta segurança da WOOHP. No início, as espiãs ficam nervosas, até se deparam com o bandido, uma senhora de 80 anos, muito doce.

Agora que Blaine é o namorado oficial de Clover, ela está mais feliz do que nunca. Na verdade, ela está convencida de que ele é sua alma gêmea. Apesar de tudo estar indo bem no relacionamento, a vida secreta de Clover está conturbada.

Com Blaine em uma missão secreta, Clover tenta se animar, fazendo todas as coisas que ela gosta de fazer, como ir a um spa, fazer compras em sua loja favorita e comer no seu restaurante vegetariano. Clover fica horrorizada ao descobrir que a boutique foi substituída por uma lojinha, o restaurante vegetariano é uma churrascaria, e agora o spa exclusivo está aberto ao público!

É semana das atividades universitárias em Malibu e Clover está empolgada porque ela ingressou em uma nova irmandade. Sam e Alex não estão muito interessadas, especialmente quando elas descobrem que Mandy e sua igualmente detestável prima Mindy também fazem parte da irmandade!

Quando Jerry decide que é hora de trabalhar um pouco na Europa, ele traz as meninas com ele para trabalhar no escritório europeu da WOOHP em Paris, que está localizado abaixo da Torre Eiffel. Para a sua primeira missão, elas devem investigar a equipe romena de ginastas.

Sem nenhuma anormalidade acontecendo no mundo da espionagem, Sam, Clover e Alex decidem dar um pequeno passeio na Itália. Eles chegam numa vila pitoresca, San Geminiani, que tem a imagem de plena serenidade. Infelizmente, a serenidade não dura muito. Em outro momento, Sam tem um desejo: conhecer Roma.

Na sua terceira e última missão na Europa, Sam, Clover e Alex são enviadas para verificar o desaparecimento misterioso de vários críticos de moda europeus.

Quando Sam, Clover e Alex encontram-se sob ataque em vários locais ao longo de Malibu, elas começam a suspeitar que, devido à natureza dos ataques, bandidos do passados têm a culpa. No entanto, quando Jerry informa que os bandidos ainda estão garantidos na prisão da WOOHP, as meninas ficam perplexas.

É dia ensolarado no campus de Malibu. Sam, Clover e Britney passeiam pela academia, de repente, ouvem um som estranho. Para seu grande choque e surpresa, elas olham para cima para ver um grupo de estudantes fazendo o que parece ser a rotina de exercícios oficialmente sancionados da WOOHP! Incrédulas, elas perguntam o que está acontecendo.

Quando Clover lê sobre a abertura de um novo hotel subaquático na costa de Malibu, ela fica empolgada. Só que quando ela tenta fazer uma reserva, disseram que é só para VIPs. A menos que ela seja uma estrela de cinema, cantora pop ou celebridade, não é bem-vinda. Enquanto isso, Jerry informa as meninas que os níveis de água ao redor da Terra estão em ascensão.

Os cientistas fazem uma descoberta na Antártida: Yeti, uma criatura parecida com neve congelada em um bloco de gelo! Jerry informa à Sam, Clover e Alex, que tem havido relatos de um estranho ser aterrorizando um luxuoso resort de esqui. Quando elas chegam para investigar o local luxuoso, elas acham que elas não são os únicos no caso Martin Mystery, um investigador paranormal adolescente.

As espiãs são enviadas para investigar os relatos de ataques estranhos a restaurantes de sushi! Podem Clover e Alex reunir estas pistas estranhas e derrotar o criminoso, mesmo com Sam deixando-as no meio das missões? Em outro momento, Sam precisa manter um segredo longe de Alex e Clover. É uma missão pessoal: ela tem que espionar um ex-prisioneiro da WOOHP que cumpriu sua pena.

Preocupadas com sua amiga, Alex e Clover decidem que a única maneira de descobrir o que há de errado com Sam é espioná-la! Mas o que vai acontecer quando elas descobrem que Sam está envolvida em algumas atividades obscuras?

Jazz Hands abre o seu próprio parque temático malvado: Mundo da Mímica! As espiãs trabalham secretamente no parque temático para descobrir o que seu plano é, mas é maior e mais aterrorizante do que elas esperavam!

Quando ataques estranhos acontecem com estudantes por todo o campus de Malibu, Jerry envia Sam, Clover e Alex para investigar. Seria apenas uma coincidência de que todos os ataques tivessem acontecido somente com atletas?

Clover começa a ter aulas de teatro em Malibu, e muito em breve, todos em torno do campus começa a agir estranhamente! Qualquer um que esteja no teatro começa a agir como seu personagem dentro e fora do palco. Existe algo mais do que apenas este método de atuação estranho?

Jerry envia as espiãs em uma missão onde elas devem rapidamente capturar um vilão ridículo.

No piquenique da WOOHP anual, as meninas são surpreendidas quando o prêmio de agente da WOOHP fantástico vai para ninguém menos que Clover, pela captura do Senhor Starchy, um um vilão maluco que pretendia "engomar o mundo" e que tem escapado da WOOHP por décadas.

É tarde de sábado e, depois de Jerry dizer as meninas que não tem nenhuma missão para elas, Sam, Clover e Alex vão para um dia de compras no groove! Como um bônus adicionado, quando elas chegam lá eles descobrem que não há qualquer mal de compras - o que torna o acesso fácil a todas as suas boutiques favoritas.

É a época de férias, mas as espiãs não estão de férias. Sua última missão é investigar um objeto voador não identificado - acima de Beverly Hills! Após a investigação terminar, começar a nevar em toda a Califórnia.

Quando há ocorrências estranhas em Beverly Hills, tornados imundos, cheios de lodo e enormes nuvens de poeira, Jerry envia as espiãs para investigar o estranho fenômeno. As meninas descobrem que alguém parece estar fazendo isto propositadamente a fim de transformar a cidade amada das garotas, mas que pessoa terrível iria querer fazer isso?

Quando a mãe de Jerry, Sra. Lewis, acidentalmente ingere uma dose de uma concentração de pura maldade, ela torna-se malvada. Sob o pseudônimo de "Sr. X", ela engana Jerry para que demita os agentes da WOOHP, e os substitua por robôs. As meninas estão chocadas na virada repentina de eventos, e quando uma onda de crimes começa no shopping, os robôs reagem mal.

Alex, Sam e Clover usam uma nova máquina de Jerry para destruir o mal em todo o mundo. Infelizmente, a máquina só funciona em seres humanos, não em robôs. Elas vão se encontrar com os robôs e, eventualmente, vencê-los. As meninas vão embora, prometendo voltar para ver Jerry novamente. Em outro momento, Mandy se torna amiga das garotas, depois de perder sua memória.