MacGyver

Três meses depois de sair da Fundação Phoenix e se mudar para a Nigéria, Mac deixa de lado suas desavenças com seu pai e volta quando sabe que Jack está na mira de um ditador assassino que ele traiu, no primeiro episódio da terceira temporada.

Jack recebe um pedido de socorro de um de seus antigos companheiros da Delta que está sendo injustamente acusado de terrorismo num país estrangeiro e MacGyver e Jack rapidamente recrutam o resto da equipe Delta e preparam uma operação de resgate não autorizada.

MacGyver, Riley, Bozer e Leanna se infiltram num campus universitário para descobrir quem está recrutando estudantes para ataques mortais em todo o mundo. Enquanto isso, Jack se une a Billy Colton (Lance Gross), caçador de recompensas, para encontrar um criminoso fugitivo, mas se preocupa quando descobre que Billy ofereceu emprego a Riley.

Com a ajuda de Vasil (C. Thomas Howell), um pai angustiado, Mac e Riley devem achar uma maneira de dirigir um caminhão cheio de oxigênio líquido, passando por uma região ocupada por rebeldes, e entregá-lo a um hospital infantil antes que seu estoque acabe. Enquanto isso, Riley ajuda MacGyver a decidir se permite ou não que seu pai faça parte de sua vida novamente.

Quando Oversight's tenta capturar o líder de um cartel de drogas dá errado, MacGyver e Jack vão pro México pra retirar seu chefe enquanto estão correndo pelo coração da cidade nas festividades de dia dos mortos.

Murdoc rapta a namorada de MacGyver, Nasha (Sibongile Mlambo), para forçar Mac a ajudá-lo a resgatar seu filho, Cassian (Brady Bond), que foi sequestrado. Mac conhece melhor Murdoc quando uma pessoa perigosa que faz parte da vida pessoal e do passado do vilão entra em cena.

Matty envia MacGyver e sua equipe a Gana para recuperar um disco rígido de um depósito de lixo eletrônico administrado por um homem poderoso e violento. Mas quando Matty se recusa a revelar o que está no disco rígido, além de um misterioso arquivo chamado "Dragonfly", a equipe tenta imaginar o que poderia ser tão importante para ela.

MacGyver e a equipe partem para uma perigosa operação de captura depois que um oficial da inteligência militar irlandesa os procura dizendo que conhece o paradeiro de um fabricante de bombas que Mac tenta encontrar há muitos anos, conhecido como “O Fantasma”.

Quando um frasco contendo um vírus letal é roubado do Centro de Controle e Prevenção de Doenças em Atlanta, MacGyver e sua equipe correm para recuperá-lo antes que o ladrão provoque uma pandemia.

Matty revela um segredo chocante para sua equipe: ela tem um marido que está infiltrado há oito anos numa organização criminosa chamada S-Company. Depois que descobrem que ele é agente da CIA, Matty precisa que MacGyver encontre e salve seu marido antes que seja tarde demais.

As miniférias de Jack e Mac em Las Vegas são interrompidas quando uma pessoa que faz parte do seu passado os sequestra e os prende num quarto de concreto. Enquanto isso, Matty envia Riley, Bozer e Leanna numa missão para roubarem um diamante que contém informações de terroristas sobre uma princesa em Milão.

A Phoenix se une a uma mulher que é uma mãe dedicada durante o dia e uma exímia ladra durante a noite para pegar um de seus contatos, um criminoso do submundo que a contratou para roubar uma bomba suja.

MacGyver leva Riley e Bozer para um fim de semana de treinamento de sobrevivência na selva, mas tudo muda quando eles se deparam com um grupo de criminosos violentos que estão vasculhando o terreno acidentado em busca de uma caixa com dinheiro roubado. Enquanto isso, Jack e Matty pegam a estrada para levar o ex-marido de Matty e sua família para o programa de proteção a testemunhas.

O chefe de uma quadrilha internacional faz uma proposta irrecusável a Matty: ele se entregará se puder voltar aos Estados Unidos para levar sua filha ao altar. MacGyver e sua equipe entram de penetra no casamento para garantir que ele não vai fugir, mas descobrem que não são os únicos que participam do evento com segundas intenções.

Depois da entrada triunfal e surpreendente de Desi (Levy Tran), a mais nova recruta da Phoenix, MacGyver e sua equipe recebem a missão de acompanhar e proteger um cão farejador da ATF (agência americana de repressão a álcool, tabaco, armas de fogo e explosivos) que tem sua cabeça a prêmio. Mas eles logo descobrem que não são os únicos que querem o cachorro.

A Phoenix deve recuperar o corpo de um piloto cujo avião caiu enquanto testava um sistema a laser para mapeamento experimental projetado por MacGyver. Enquanto isso, Riley tenta identificar o hacker que enganou uma equipe da SWAT e fez com que prendessem Elwood e ela.

MacGyver e a equipe devem elucidar um mistério de um homem que sumiu e que trabalhava num banco de sementes internacional altamente seguro, num lugar remoto.

Quando Nicholas Helman (Michael Des Barres) reaparece com a missão de matar várias pessoas, a Phoenix é forçada a buscar a ajuda de quem o conhece melhor... Murdoc, seu protegido.

MacGyver e Desi ajudam um grupo de refugiados sírios que estão sendo perseguidos por traficantes de pessoas. Enquanto isso, em Los Angeles, Bozer está preso num carro da organização que pode explodir a qualquer momento.

Quando dois turistas americanos somem enquanto participam do "Desafio Impossível" num dos países mais perigosos do mundo, os integrantes da equipe da Phoenix se disfarçam de mochileiros e vão até o local para encontrá-los e levá-los para casa sãos e salvos.

Depois que Ethan (Brendan Hines), ex-marido de Matty, pede que ela o ajude quando a organização criminosa S-Company sequestra sua esposa e filha, Matty é forçada a decidir se está disposta a cometer traição para ajudá-lo a salvar sua família. Enquanto isso, Riley embarca numa missão para Paris com Billy Colton (Lance Gross) e Mama Colton (Sheryl Lee Ralph) e sofre uma grande desilusão.

MacGyver enfrenta um novo e ardiloso adversário cujos planos cuidadosamente arquitetados o colocam diante de uma escolha impossível: salvar a vida de um amigo ou salvar as vidas de centenas de pessoas inocentes. Além disso, Mac recebe novas informações que vão abalar sua relação com o pai, nesse episódio final da terceira temporada.