La quinta stagione inizia 18 mesi dopo che Jack Bauer, costretto a fingersi morto, ha assunto una nuova identità. Ora conduce una vita tranquilla, ma una falla nel sistema di sicurezza nazionale lo costringe ad uscire dall'anonimato. Al CTU, Bill Buchanan e gli altri rispondono ad una serie di tragedie. Per fronteggiare l'emergenza, il presidente Logan firma un trattato sulle armi.
