A incerteza está no ar quando Pacey e Joey voltam a Capeside depois de sua viagem de férias.

Enquanto o novo ano letivo encontra Pacey prestes a ser reprovado, Henry chama Jack para terminar o namoro com Jen; Joey vai trabalhar num iate clube.

Um furacão ameaça Pacey e Jen e força Dawson e Joey a salvar suas vidas.

O processo de inscrição em faculdades se intensifica, e Drue organiza uma festa falsa para Jen.

Dawson descobre que a mãe está grávida, e Joey tem de decidir quando começará a transar com Pacey; a orientação sexual de Jack é empecilho para que ele seja treinador de um time de futebol infantil.

O esforço de Andie para comemorar sua entrada em Harvard acaba pondo sua vida em risco.

Uma oportunidade de descanso antes de ir para a faculdade faz com que Andie tente reunir todos antes de partir.

Dawson, Pacey e Jack são suspeitos de aprontar uma pegadinha.

Dawson busca o conselho do Sr. Brooks sobre se tornar diretor; Joey leva Pacey a um jantar oferecido por uma faculdade exclusiva.

A revelação do Sr. Brooks sobre o seu passado inspira Dawson, e Pacey se anima para continuar o relacionamento com Joey.

Pacey tenta dissuadir Dawson a dar em cima de sua irmã; por brincadeira, Drue e Joey acabam trancados em um armário.

A festa de aniversário surpresa que Pacey prepara para Joey aumenta as já antigas tensões na família Witter.

Dawson não está nada à vontade em encontrar os amigos de Gretchen; Joey e Pacey são chamados para ajudar Drue num evento importante.

Os amigos de Dawson lidam com questões sexuais durante uma viagem para esquiar, e Dawson descobre que tem poder sobre a vida do Sr. Brooks.

Pacey e Joey analisam sua primeira experiência sexual, e a morte de Brooks faz com que Dawson e Gretchen se concentrem em sua relação; um psicólogo pressiona Jen sobre seu passado, enquanto Dawson pergunta a Joey se ela transou.

A tentativa de Pacey e Joey para passarem uma noite juntos cria uma oportunidade para Dawson e Gretchen; Jen chama Jack para ajudar a espiar seu terapeuta.

A alegria com a entrada de Joey na faculdade diminui quando ela descobre quanto o curso vai custar.

Dawson e Gretchen vão para o Maine em um dia de folga na escola; Jen leva Joey para Nova York para um confronto com seu pai.

Gale lida com o atraso no nascimento do bebê, e Joey acha que pode estar grávida.

Enquanto desencadeia alguns possíveis romances, o baile de formatura de Capeside ameaça o futuro de outros dois.

A volta de Gretchen para a faculdade força Dawson a tomar uma decisão importante; Jen impede que Grams venda a casa para pagar seu curso na faculdade.

A formatura da Turma de 2001 reúne amigos e família e os prepara para se separarem.

Enquanto Dawson se prepara para ir para a faculdade, ele e Joey se reúnem para uma despedida.