Mother kuvaa seitsemää ratkaisevaa päivää vuonna 1948, jolloin abbedissa Teresa (Noomi Rapace) odottaa Vatikaanin lupaa lähteä Intiassa sijaitsevasta luostaristaan aloittaakseen oman lähetystyönsä. Samaan aikaan hän saa järkyttävän uutisen sisar Agnieszkalta, oletetulta seuraajaltaan luostarissa.

Minnesotan Normalissa seriffin sijainen Ulysses ja kaksi pankkiryöstäjää tajuavat kaupungin olevan Yakuzan kulissi. Ulysses surmaa lahjotun pormestarin ja saa tietää, että seriffi tapettiin sopimuksen suojelemiseksi. He salaavat tapahtumat selviytyäkseen Yakuzan tulosta. Syntyy kuitenkin kaaos, kun Yakuzan johtaja kuolee vahingossa. Kaupunki jatkaa entiseen malliin välttääkseen sodan.