Après les agressions du final explosif de la saison 5, l'équipe doit maintenant essayer de comprendre pourquoi elle a été prise pour cible et s'il y a un plan plus important en place. Pendant ce temps, Nolan doit survivre à sa dernière garde avant son mariage avec Bailey.

L'équipe se réunit pour célébrer le mariage de John et Bailey ; pendant ce temps, Celina découvre une anomalie dans son affaire, ce qui l'amène à faire une découverte. Ailleurs, la relation entre Lucy et Tim est mise à l'épreuve.

La lune de miel de Nolan et Bailey tient plus du cauchemar que du rêve lorsqu'elle se transforme en scène de crime. Pendant ce temps, Tim et Celina s'associent et doivent découvrir l'identité d'un inconnu.

C'est le premier jour de travail de l'agent Aaron Thorsen depuis l'agression, et il est chargé d'une série d'affaires très stressantes pour déterminer s'il est prêt à travailler. Ailleurs, l'équipe enquête sur un homicide qui pourrait être lié au tueur au pentagramme.

Lorsqu'un enfant en bas âge est retrouvé sur les lieux d'un crime, John et Bailey doivent décider s'il faut laisser l'enfant dans un refuge pour la nuit ou s'en occuper eux-mêmes. Pendant ce temps, lorsque quelqu'un de son passé revient, Tim disparaît et laisse Lucy dans l'ignorance.

Après avoir été famille d'accueil, Bailey a décidé d'avoir un bébé et oblige John à reconsidérer leur décision de ne pas avoir d'enfants. Pendant ce temps, John et Celina découvrent une évadée de prison dont ils craignent qu'elle ne veuille se venger et se lancent à sa recherche avant qu'il ne soit trop tard.

Lorsque deux adolescentes disparaissent, c'est à toute l'équipe de retrouver les filles et de découvrir la vérité sur leur disparition. Pendant ce temps, Lopez et Harper mènent une enquête d'un autre genre : la recherche de la nounou idéale.

Après un accident de masse lié à la mafia, l'équipe est chargée de maintenir la paix à l'hôpital. Lucy et Celina travaillent ensemble pour enquêter sur les suspects de l'attaque. Pendant ce temps, Tim et Aaron s'embarquent dans une mission d'opération métropolitaine.

L'officier Nolan et Celina s'occupent d'une affaire spéciale ; pendant ce temps, Monica demande de l'aide pour identifier ses agresseurs. Ailleurs, Lopez et Harper découvrent un lien avec la piste des crimes.

Le sergent Grey aide l'équipe à se préparer à sa plus grande mission. Pendant ce temps, Aaron, Lopez, Celina, Tim et Smitty découvrent un lien surprenant dans leur affaire.