Nine, der Sonic und Shadow betrogen hat, entwischt mit den Bruchstücken in seine Trümmerwelt namens Öde, in der er das Paradox-Prisma endlich zusammensetzen will. Während sich das Chaos-Komitee nach New Yoke City zurückzieht, sind Sonic und Shadow fest entschlossen, ihren ehemaligen Verbündeten zur Rede stellen. Nine weigert sich, sein Vorhaben fallen zu lassen, und nimmt Sonic ins Visier.
