Naruto Shippuden

El Equipo Jiraiya saldrá a su primera misión, para investigar el rapto de unos jounin en circunstancias desconocidas.

Durante la misión de reconocimiento, los líderes de los equipos desaparecen de repente en extrañas circunstancias. Mientras buscan al resto de equipos, el Equipo Asuma se encuentra con tres jounin que se hacen llamar el Equipo Jiraiya.

Dos niños indefensos de la aldea abandonada donde suceden los combates son víctimas de un terrible accidente. El Equipo Jiraiya intenta ayudarlos, pero en los canales subterráneos donde cayeron habita una criatura enorme y peligrosa. La verdad tras la desaparición de los líderes de equipo se revela.

Naruto lucha por controlar el chakra del kyubi recordando las enseñanzas de su padre, pero hiere a Jiraiya en el proceso. Mientras tanto, Sasuke y el resto se enfrentan al marionetista desconocido.

Naruto regresa de su entrenamiento con Jiraiya y se encuentra con que Sasuke, que ahora es vicecapitán de la Policía Militar de Konoha, está abusando de su poder. A raíz de un problema ocasionado por los subordinados de Sasuke, Naruto y Sasuke se enfrentan de nuevo.

La nueva obra de Jiraiya promete rovolucionar el mundo de los ninja. La historia gira al rededor de un chico que se convierte en Jinchuriki cuando sellan al Kyubi en su interior, y debe luchar contra los prejuicios de aquellos que lo consideran un peligro. Y el nombre de aquel chico es Naruto.

La batalla contra los monstruos subterráneos termina y Neji conoce la verdad oculta tras la muerte de su padre.

El Equipo Asuma y el Equipo Kurenai finalmente se reúnen y parten en busca del resto. Por otro lado, Sasuke y Sakura son atacados por un poderoso enemigo, al igual que Lee y Tenten.

El Equipo Asuma y Kurenai finalmente se reencuentran con Lee y Tenten, y salen de inmediato en auxilio de Sasuke y Sakura, que se encuentran en un grave peligro.

El experimento del enmascarado llega a su fin. Los compañeros secuestrados son liberados y Neji consigue la oportunidad de volver a hablar con su padre.

La misión termina con un giro inesperado. De regreso en la aldea, Sasuke entrena para dominar un nuevo jutsu que se gane el reconocimiento de su padre. Cuando Naruto se entera, también buscará aprender una nueva técnica.

Sasuke deja el Equipo 7 y se une a un equipo especial Uchiha que se encargará de una importante misión para un Señor Feudal. Al mismo tiempo, Naruto decide irse a entrenar con Jiraiya. La rivalidad entre Sasuke y Naruto crece a peligrosas proporciones.

Sasuke abandona Konoha para ir en busca de Orochimaru y así adquirir más poder, pero cuando Naruto y el resto de compañeros se entera, deciden seguirlo para intentar detenerlo y llevarlo de vuelta a Konoha.

Un grupo de ANBU pertenecientes a Raíz persiguen a Naruto y al resto del grupo que fueron tras Sasuke. Cuando descubren que su objetivo es impedir que lleguen hasta donde Sasuke, Lee y Tenten harán frente al peligroso grupo.

Naruto y Shikamaru son los únicos en llegar a la torre donde se encuentra Sasuke. Sin embargo, solo Naruto puede convencer a Sasuke para que regrese. El ansia de poder de Sasuke lo llevará a enfrentar a Naruto en una batalla colosal.

Cuando Naruto despierta, Sasuke ya se ha ido. De regreso en la aldea de Konoha, Yahiko, quien ahora es Pain de Akatsuki, descarga su ira sobre los aldeanos.

Kushina ayuda a Naruto a controlar su ira para poder derrotar al último de los cuerpos de Pain.

Sasuke se une a Akatsuki, por lo que Konoha envía a Naruto y al resto para que intenten detenerlo y traerlo de vuelta.

Sasuke y Naruto se enfrentan en una batalla descomunal donde por fin confiesan sus verdaderos sentimientos.