Det utspelar sig i 2012, tre år innan filmen Jurassic World. LEGO Jurassic World: Legenden om Isla Nublar tar vid där historien slutade i LEGO Jurassic World: Den Hemliga Utställningen. Den nyanställde djurtränaren Owen Grady och vice nöjesparkchefen Claire Dearing är kollegor på Isla Nublar och försöker lösa alla problem som uppstår i Jurassic World.