Mary Queen of Scots skildrar Maria Stuarts turbulenta liv. Hon blir Frankrikes drottning vid 16 års ålder men när hon som 18-åring blir änka, återvänder hon till Skottland för att återta sin rättmätiga tron. Genom födslorätt kan hon också göra anspråk på Englands tron, där drottning Elizabeth I regerar. De båda drottningarna rivaliserar både om makt och kärlek och väljer helt olika vägar.
