If Her Flag Breaks

Flag mostra os diferentes caminhos que o destino pode tomar. Hatate Souta entra na Escola Hatagaya, e consegue ver diferentes bandeiras, e as controlar. Souta tenta evitar as pessoas depois que algo aconteceu em seu passado, mas Nanami nota que havia algo de errado quando Souta para um acidente prestes a acontecer no seu caminho para a escola.

Souta reencontra sua amiga de infância, Shoukanji Kikuno, que ama o mimar. O Dormitório Quest está caindo aos pedaços, e Kikuno pede para a veterana na escola, Tsumigi, e para a presidente do conselho, Mimori, ajudarem.

Todos estão prestes a começar sua vida no Dormitório Quest quando Akane recebe um misterioso robô em forma de menina chamado Ruri. Enquanto isso, a presidente do conselho de Hatagaya anuncia o começo de um novo evento.

O evento começa. Um novo membro se junta ao grupoo, e todos se esforçam muito para fazer com que o Dormitório Quest não tenha que ser fechado e Souta seja expulso.

Souta promete sair com Akane e o resto do Dormitório descobre e quer ir também. Mas Nanami fica em casa enquanto Souta sai com Megumu, Akane, Rin e Kikuno.

Mei, uma misteriosa nova aluna entra na Sala 1-F da Escola Hatagaya. Parece que ela tem a mesma habilidade de ver bandeiras e as manipular que Souta.

A Escola Hatagaya faz uma excursão à praia, e Souta conhece Kurumiko lá. Souta pede ajuda à Mimori, e sai com ela para retribuir o favor.

Souta volta para casa com Kikuno durante as ferias de verão, e é mimado por ela. Ruri aparece do nada e o sequestra. Todos no Dormitório Quest estão preocupados, menos Nanami...

Todos do Dormitório Quest vão para o país de origem de Nanami, o Principado de Bladefield, e encontram a irmãzinha de Nanami, Hakua, a princesa atual.

Hakua se muda para a Escola Hatagaya, e lá acontecerá um Festival Escolar. Souta é enganado e tem que recomendar todas as meninas do Dormitório Quest para o concurso de beleza que acontecerá no Festival.

A menina misteriosa no fim é Serika, também conhecida como Sericcham, a estrela amada por todo Japão. Ela irá fazer um show no último dia do festival. Souta e Nanami descobrem que ela virou uma estrela por causa de Souta.

No dia da formatura, todos os membros do Dormitório Quest estão rumando em caminhos diferentes, e o Dormitório será demolido.

As meninas lutam com Angelus Gemini, enquanto Souta se pergunta porque elas vieram, sentindo que não há como retribuir o que elas fizeram por ele.