12 몽키즈

바이러스가 인류 대부분을 멸망시킨 지 27년 후, 과학자들이 제임스 콜이란 남자를 2015년으로 보내 전염병의 발생을 막으려 한다. 콜의 유일한 단서는 바이러스학자, 카산드라 레일리 박사인데 그녀만이 전염병의 근원을 알고 있다.

'12 몽키즈 부대'라는 수상한 조직을 쫓다가 콜은 2015년의 한 정신병원으로 가게 되는데 그 병원에 입원한 환자가 세계를 멸망시킨 전염병의 열쇠를 갖고 있다. 한편, 그녀가 가담하면 역사가 바뀔지 모른다는 경고에도 불구하고, 레일리 박사는 목숨을 걸고 콜을 돕는다.

바이러스의 위치를 쫓으려 콜은 2014년으로 가는데, 아이티에 위험한 전염병이 발병하고, 그것이 레일리 박사에게 절망적인 순간을 가져온다.

위험한 약탈자 무리가 콜과 램지를 추격해서 과거를 구하기 위한 임무가 위태로워지고, 미래를 위한 싸움이 벌어진다.

콜과 레일리 박사는 나이트 룸을 발견하면서 12 몽키즈 부대와 맞서게 된다. 나이트 룸은 비밀 연구실로 언젠가 세계를 멸망시킬 바이러스가 저장된 곳이다.

나이트 룸에서 일어난 비극으로 2043년의 현실이 바뀌게 되고, 콜은 레일리 박사를 구하기 위해 자신의 미래를 위험에 노출한다.

콜, 레일리, 아론은 바이러스가 생화학 무기로 체첸에 사용되는 것을 막으려 한다.

타임머신을 작동하게 하는 코어가 망가진다. 콜을 과거로부터 데려오기 위해 존스는 '스피어헤드'의 옛 동료들에게 자신의 임무가 구할 가치가 있다고 설득해야 한다.

콜은 전염병이 한창인 2017년으로 가게 된다. 선택의 여지가 없어진 존스는 코어를 대체하기 위해 불가능한 선택과 대면한다.

램지가 새로 찾은 가족을 보호하기 위해 필요한 일을 할 때 콜은 남아서 뒷감당을 하게 된다

12 몽키즈 부대를 막으려는 마지막 시도를 위해 콜은 1987년의 도쿄로 가게 된다.

콜은 시간여행의 부작용으로 죽어가고, 레일리는 콜을 구할 수 있는 유일한 사람을 찾아내야 한다.

시즌 마지막회에서, 콜과 레일리는 가장 가까운 적들과 최후의 대결을 하고, 존스는 그녀가 이룬 모든 것을 위협하는 새로운 적을 맞이한다.