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Nel pronto soccorso dell’Ospedale Generale di Chicago, un Centro Traumi e una struttura di insegnamento, la differenza tra la vita e la morte dipende dalle decisioni prese in un secondo.

Maggie, la prepotente madre di Abby, arriva all’ospedale per confortare Abby e Kovac quando la vita del loro figlio appena arrivato è in pericolo.

Pratt assume il suo nuovo ruolo di medico curante, ma si ritrova in una situazione difficile con tutti i nuovi tirocinanti.

Gates deve fronteggiare le sue complicate condizioni di vita. Dopo aver cercato di gestire il lavoro e il bambino appena arrivato, Abby e Kovac pensano di assumere un’aiutante.

Quando ritorna al lavoro dopo l’aspettativa per maternità, Abby teme di aver perso le sue capacità professionali.

Temendo il peggio, Kovac aspetta ansiosamente la decisione della giuria nel caso che lo contrappone a Curtis Ames (guest star ricorrente FOREST WHITAKER).

Abby e Kovac finalmente decidono di assumere una tata per loro figlio, ma sono preoccupati quando incontrano le potenziali candidate.

Abby e Kovac litigano riguardo ad una diagnosi, quando una donna si presenta con segni di abuso coniugale. Weaver viene chiamata all’azione mentre prepara un rapporto in una scuola.

È il Giorno del Ringraziamento e il pronto soccorso è in subbuglio. Abby sta per andare a casa quando è costretta ad occuparsi di un incidente d’autobus a lato di un burrone.

Pratt has a tough time coming to terms with the discovery of his brother's sexual orientation. Outside his apartment, Kovac spots Ames but Kovac chooses not to tell Abby.

Al culmine dello spirito natalizio, le storie d’amore infiammano il pronto soccorso.

Quando un paziente muore dopo aver assunto il medicinale sbagliato, Pratt e la studentessa Hope (guest star ricorrente BUSY PHILLIPS) si chiedono se sono responsabili.

Kovac si ingelosisce quando Abby presta attenzione ad un paziente, Eddie Jackson. Meg, la compagna di stanza di Gates, escogita una trovata mortale quando l’uomo lascia l’appartamento.

Gates e Neela cercano di rianimare Meg quando la trovano priva di coscienza nell’auto. Sam pensa di sapere chi ha fatto scoppiare l’incendio a casa sua.

Abby e Sam cercano di curare un aspirante comico, Simon (FREDDY RODRIGUEZ), con sintomi misteriosi. Pratt si trova nei guai quando viene interrogato riguardo alla morte di un paziente.

Quando una donna arriva al pronto soccorso con un collasso epatico acuto, Gates e Kovac devono affrontare un dilemma morale.

Abby e Pratt si affrettano a salvare una famiglia che è rimasta incastrata nella neve e sta ora soffrendo di congelamento. Neela è gelosa quando Dubenko accetta una nuova tirocinante.

Sam e Morris sono sorpresi quando una fotografa, Diana Moore, arriva al pronto soccorso per scattare foto accanto al letto di un paziente terminale.

Quando un ragazzo, Danny Rutley, si presenta al pronto soccorso con uno scompenso cardiaco, Kovac e Gates devono affrontare Wayne, l’inerme padre di Danny.

Nell’industrioso pronto soccorso, Kovac è sottoposto a forti pressioni quando si deve occupare di troppi casi prima che l’area venga chiusa per i restauri.

Tutto il personale del pronto soccorso è colto alla sprovvista quando si presenta alla cena del reparto e scopre che stanno per essere celebrate nozze a sorpresa.

Kovac e Abby si abituano al loro nuovo ruolo di marito e moglie, mentre Hope e Morris trascorrono giornate piacevoli nella suite della luna di miele non usata dei due coniugi.

Nel finale della 13ᵃ stagione, con il disappunto dello staff, il nuovo capo Moretti (guest star ricorrente STANLEY TUCCI) apporta alcune modifiche importanti all'interno del pronto soccorso.