NCIS

Nel primo episodio della 16ª stagione, un mese dopo il rapimento del direttore Vance, a Gibbs viene assegnato il ruolo di direttore pro tempore in sua assenza. Il team cerca l'uomo in tutto il mondo.

Un tenente della marina viene trovato assassinato nella vasca idromassaggio e il team interroga diverse famiglie nello strano quartiere della vittima. Intanto, Torres deve affrontare le conseguenze di un'esplosiva serata con Palmer.

Il team indaga su un'esplosione fuori dalla casa del sottufficiale di prima classe della marina Todd Nicholas (Cameron Radice) e di sua moglie, la popolare star dei reality Sheba Nicholas (Tara Holt), e uno degli agenti NCIS ne rimane affascinato.

La vacanza di Gibbs nella sua baita viene interrotta da una visita di Tobias Fornell (Joe Spano) insieme al capitano della marina Phillip Brooks, e da una chiamata dell'NCIS che gli chiede aiuto per individuare un ladro nascosto nei boschi.

Dopo il ritrovamento di una registrazione audio lasciata dalla vittima di un omicidio 50 anni prima, il team NCIS cerca di scagionare Ray Jennings (Charlie Robinson), il Marine che sta scontando una condanna all'ergastolo per il delitto.

L'NCIS arriva su una scena del crimine e Torres riconosce la vittima, un vecchio amico dell'accademia di polizia. Nel frattempo, Jimmy pensa che il laboratorio sia infestato dai fantasmi perché gli oggetti cambiano posto misteriosamente.

Un murale di uno street artist e attivista viene rubato e l'indagine dell'NCIS porta a una cospirazione che coinvolge un consulente della marina e la protezione dei mammiferi dell'oceano. Bishop condivide un legame speciale con lo street artist.

McGee e Bishop vanno in Afghanistan perché un caso di omicidio negli USA è collegato a una serie di soldati uccisi dal fuoco amico all'estero. Intanto, Kasie lascia il laboratorio e accompagna Torres sul campo per valutare ulteriori prove forensi.

Quando la principale indiziata di un caso irrisolto di furto di alto profilo viene rilasciata, il team NCIS riprende l'indagine e inizia a sorvegliarla.

I programmi per le vacanze del team sono messi da parte quando l'indagine sull'omicidio di un veterano della marina portano alla scoperta di un neonato non identificato e senza apparenti legami con una famiglia.

Il Segretario alla difesa degli Stati Uniti Wynn Crawford (Mitch Pileggi) blocca l'indagine per omicidio di Gibbs e chiede l'arresto degli agenti speciali McGee e Torres per il loro comportamento durante l'indagine.

Un vecchio amico di famiglia, il caporale John Sydney (Dabney Coleman), supplica Gibbs di partire con lui per cercare un braccialetto identificativo perduto. Intanto, un tenente sotto custodia protettiva dell'NCIS viene avvelenato da uno spacciatore.

Una bambina di 9 anni confusa e malnutrita viene ritrovata in un magazzino e l'NCIS riapre un vecchio caso di scomparsa, dato che si pensa possa essere la figlia di una recluta della marina scomparsa 10 anni prima.

Il team NCIS indaga su un incidente mortale a bordo di un cacciatorpediniere della marina. Torres non è felice per l'incarico assegnato da Vance di mentore di tre studenti delle superiori.

Jimmy è combattuto tra famiglia e lavoro dopo che il suocero, Ed (Larry Miller), gli chiede di manomettere le prove di un'indagine per omicidio dell'NCIS.

Il direttore Vance viene informato dal Pentagono che il sottomarino nucleare su cui si trovano Gibbs e Bishop per indagare su un omicidio non risponde più.

Torres si affida alle capacità investigative del team dopo essersi risvegliato su un peschereccio fatiscente, ricoperto di sangue e incapace di ricordare le ultime 12 ore.

Dopo una sparatoria in un ospedale della marina, il team NCIS cerca un sospetto che è riuscito a scappare. Intanto, una persona appartenente al passato di Sloane si trovava all'interno dell'ospedale ed è un testimone chiave del caso.

L'NCIS indaga sull'omicidio di un maggiore dei Marines creduta morta durante l'attacco dell'11 settembre al Pentagono, dopo che in un cantiere vengono ritrovati alcuni resti. Una storia personale con la vittima spinge Gibbs a risolvere il caso.

Dopo aver inserito il DNA di un cold case nel sistema, Kasie risolve un omicidio di 30 anni prima, ma una scappatoia legale potrebbe rimettere in libertà il sospettato.

L'NCIS scopre un conto bancario governativo segreto che finanzia una rete nazionale di giustizieri e deve capire chi agisce in qualità di giudice e chi di giuria.

Il team NCIS indaga sull'uccisione di un sergente dei Marines negli Stati Uniti, considerato un eroe di guerra per le sue imprese oltremare.

L'ex agente dell'FBI Tobias Fornell (Joe Spano) implora Gibbs di fare tutto il necessario per smantellare una rete di trafficanti e spacciatori dopo che la figlia, Emily Fornell (Juliette Angelo), viene ricoverata per un'overdose.