NCIS

En eksplosjon ved et arrangement i Washington, D.C. har et offer tilknyttet byrået. Dette endrer Parsons' syn på Gibbs og NCIS-teamet. I mellomtiden etterforsker DiNozzo og McGee saken, som sivilister uten legitimasjon, til tross for saken farlige forbindelser til dem begge, i den 11. sesongens åpningsepisode.

Tony er bestem på å finne Ziva og følger spor i Israel i søket etter å finne ut hvor hun er nå. I mellomtiden fortsetter Gibbs og teamet jakten på Parsa og hans voksende terror-ring.

NCIS-teamet må legge sin lit på Twitter i en sak som involverer en savnet marineløytnant. I mellomtiden forlegger McGee legitimasjonen sin, men forteller det ikke til Gibbs og myndighetene.

Gibbs og McGee reiser til Afghanistan når en drapssak fører til et krisesenter for afghanske kvinner, som Mike Frank har støttet i hemmelighet i årevis.

DiNozzo minnes tiden ved Baltimore politidistrikt når han ser en mistenkt fra en 15 år gammel sak ved åstedet for et drap på en skvadronmester.

NCIS samarbeider med Kystvaktens etterforskningstjeneste (CGIS) for å etterforske en mistenkelig eksplosjon ombord på en oljeplattform. I mellomtiden er ingen trygg når en mystisk vittigper setter seg NCIS som mål.

Når Gibbs drar midt under en etterforskning for å hjelpe faren gjenoppta forbindelsen med en tidligere krigsflyver, krangler Tony og McGee om hvem som burde lede teamets etterforskning av drapet på en kvartermester.

NCIS-teamet blir tvunget til å gjenoppta en påkjørsel- og drapssak når en tidligere FBI-agent, som nå er advokat, forteller Gibbs at klienten hennes har et vanntett alibi som er hemmelig. I mellomtiden blir McGee mer mistenksom på Tonys underlige oppførsel.

Når det viser seg at marineministeren ble avlyttet under et gradert møte, slår NSA-analytiker Eleanor "Ellie" Bishop, som forutsa dette sikkerhetsbruddet to år tidligere, seg sammen med NCIS for å granske saken.

Komplikasjoner melder seg når NCIS-teamet avdekker en forbindelse mellom et offer i en drapssak og kjæresten til Gibbs og agent Fornells ekskone. I mellomtiden begynner NSA-analytiker Ellie Bishop å venne seg til å bli med NCIS-teamet.

Når en mystisk sykdom rammer barn fra militærfamilier, må Gibbs og teamet etterforske årsaken. I mellomtiden slår Abby og Jimmy seg sammen med Marinens medisinske forskningssenter for å bestemme hvilken sykdom det er med håp om å finne en kur før ferien.

Når en stjålet drone knyttes til den mystiske terroristen Parsa, samarbeider NCIS-teamet med Forsvarsdepartementet, inklusiv Gibbs' tidligere kjæreste Hollis Mann, for å spore enheten før den brukes i et større angrep.

I et forsøk på å finne terroristen Parsa finner Gibbs og NCIS-teamet en av hans medsammensvorne med beviser fra droneangrepet. I mellomtiden sliter en følelsesmessig berørt McGee med den videre betydningen av hendelsen.

Drapet på et medlem av havnemyndighetene avslører Parsas mulige oppholdssted mens teamet fortsetter sin hvileløse jakt. I mellomtiden avslører Bishop sin tidligere forbindelse til den mystiske terroristen.

Når en defekt skuddsikker vest blir funnet i en lastebil fylt med stjålet krigsmateriale, forsøker NCIS-teamet å finne både kilden og andre vester som kan ha blitt sendt til militært personell i utlandet.

Når DiNozzo konfrontrerer en mann som utgir seg for å være marineoffiser, trekkes våpnene, og gjerningsmannen ender opp død. Den etterfølgende etterforskningen viser at det eneste øyenvitnet er DiNozzos far som er på besøk for å fortelle en hemmelighet til sønnen i den 250. episoden av NCIS.

Etter at en bombe eksploderer i garderoben ved en militær veldedighetskonsert, må NCIS-teamet avgjøre om målet var en avdanket rocker fra 80-tallet eller om bomben var del av en større sammensvergelse. I mellomtiden gjør Jimmy seg klar til å bli far.

Når liket av kongressmann Dan McLane, tidligere NCIS-agent, skyller i land i New Orleans, treffer Gibbs sin tidligere kollega, NCIS-spesialagent Dwayne Cassius Pride, i en felles etterforskning for de to feltkontorene og FBI.

Gibbs og spesialagent Pride følger sporene i New Orleans når bevisene peker på en gjerningsmann som etterligner den beryktede Privileged Killer. I mellomtiden sender DiNozzo en unik suvenir fra Crescent City, mens DiNozzo, McGee og FBI fortsetter å spore sakens politiske vinkel fra Washington, D.C.

Etter at hun har returnert til sin faste stilling ved Forsvarsdepartementet finner McGees kjæreste Delilah et lovende spor i en kontroversiell sak som får henne til å be NCIS-teamet om hjelp. I mellomtiden diskuterer McGee og DiNozzo hvorvidt han burde spørre Delilah som de skal flytte sammen.

En marineoffiser blir død på en landevei, og NCIS-teamet må bestemme om drapet var resultatet av et slagsmål i en bar eller om det skjedde fordi han visste for mye om et angrep på en kvinnelig medoffiser. I mellomtiden starter DiNozzo og McGee en juice-detox for å fjerne urenheter fra kroppen.

Når en marinefotograf forsvinner før han avsier vitnemål i en høring i krigsretten, etterforsker NCIS-teamet både drapet han var vitnet, samt hans siste prosjekt om hjemløse veteraner i Washington, D.C. og omegn.

Direktør Vance gir DiNozzo et spesialoppdrag: Han skal hente datteren til en admiral i Paris og ta henne hjem. Det viser seg at han må be om hjelp fra NCIS-teamet når han oppdager et kontroversielt åsted.

NCIS-teamet etterforsker om en brann ombord på en av marinens skip som ble brukt som hemmelig forvaringssted for tiltalte terrorister, var et uhell eller en bevisst avledningsmanøver i et fluktforsøk. I mellomtiden reiser Gibbs til barndomshjemmet når faren går bort i den siste episoden av sesong 11.