TRANSPARENT er tilbake med Sarah og Tammys store hvite bryllup. Maura og Ali møter gjenferd fra fortiden, mens Josh og rabbi Raquel ikke kan skjule den store nyheten sin.

Josh holder bassengfest for sitt nye band Fussypuss. Pfefferman-søsknene blir overrumplet når Maura og Shelly kommer sammen på festen. Ali oppsøker sin gamle venn Syd og Sarahs fortid hjemsøker henne.

Josh og Raquel prøver å skape familieliv i Pfefferman-huset ved å be Colton flytte inn, men Raquel ønsker mer oppmerksomhet fra Josh. Maura tar med Ali til UCLA for å diskutere videreutdanning, og der møter de den feministiske professoren Leslie Mackinaw – Mauras gamle erkefiende. Sarah har et sammenstøt med Len and Barb, og begynner et seksuelt fantasiliv med en dominerende figur fra fortiden.

Josh knytter bånd med Colton, men det har sin pris. Sarah deltar på en katastrofal skolegalla og føler seg mer utenfor enn noensinne. Ali og Syd sitter igjen med spørsmål etter et besøk hos bestemor Rose, og dette fører til et tilbakeblikk som avdekker opprinnelsen til tante Gittels ring. I mellomtiden prøver Maura å finne mer selvstendighet, men lykkes dårlig.

Josh knytter bånd med Colton, men det har sin pris. Sarah deltar på en katastrofal skolegalla og føler seg mer utenfor enn noensinne. Ali og Syd sitter igjen med spørsmål etter et besøk hos bestemor Rose, og dette fører til et tilbakeblikk som avdekker opprinnelsen til tante Gittels ring. I mellomtiden prøver Maura å finne mer selvstendighet, men lykkes dårlig.

Maura finner fellesskap med Davina og Shea, og dette inspirerer henne til å gjenskape fortiden. Det blir kulturkrasj når Coltons adoptivfamilie kommer på besøk, og Josh må ta en tøff beslutning. Ali blir enda mer tiltrukket av Leslie på en fullmåneseremoni. Sarah prøver å få orden på livet ved å gå til en livsstilsrådgiver, men velger i stedet en annen type behandling hos dr. Steve.

Ali søker råd fra Leslie om søknaden til UCLA, men kommer henne etter hvert litt for nær. Josh er nær et sammenbrudd etter han konfronterer Shelly om fortiden, mens Sarah utforsker seksuelle fantasier på en hardt tiltrengt date. Maura hjelper Davina med å gjøre seg klar for Sals hjemkomst fra fengsel og må konfrontere en tøff realitet.

Det er Jom Kippur, og Pfefferman-familien har mye å be om unnskyldning for. Sarah prøver å få tilgivelse fra Tammy, Maura sliter med å kommunisere med Davina og Josh prøver å slutte fred med Raquel. All syndsforlatelsen kulminerer på en fastebrytingsfest hos Ali og Syd, som har sin egen dype åndelige krise.

Søsterskap – og mangelen derav – flammer opp på Idylwild Wimmin's musikkfestival. Maura får en ny venn – og får en vond oppvåkning – mens Sarah opplever frigjøring fra en usannsynlig kilde. I mellomtiden befinner Ali seg på en uventet reise til fortiden.

Maura opplever en uventet kjærlighetsforbindelse og forsoner seg med familien – både i fortid og nåtid. Ali diskuterer sin akademiske fremtid med Leslie. Josh søker farskjærlighet hos Buzz. Og Sarah prøver å nøste opp løse tråder.