Amate, une lycéenne qui coule des jours paisibles dans une colonie spatiale, rencontre Nyaan, une passeuse, et se retrouve impliquée dans un trafic d'armes. Incapable de supporter la brutalité de la police militaire au cours de sa capture du mystérieux Mobile Suit connu sous le nom de Gundam Rouge, Amate monte dans le GQuuuuuuX, un modèle de dernière génération.

Pendant la Guerre d'Un An, Char, un pilote d'élite des forces de Zeon, s'empare sur Side-7 de la dernière invention de la Fédération, le Gundam.

Amate est mêlée contre son gré aux combats hors la loi de Mobile Suits connus sous le nom de Batailles de clans. Anxieuse, elle rencontre Shuji, le pilote du Gundam Rouge, à qui elle propose de former un Mav et de livrer la Bataille de clans ensemble. À bord du GQuuuuuuX, sous le pseudonyme de Machu, Amate se lance vers les profondeurs insondables de l'espace.

La Sorcière, une unicum qui a abattu plus de cent ennemis durant la Guerre d'Un An, s'inscrit à la prochaine Bataille de clans pour régler ses comptes avec le Gundam Rouge. Être mère et épouse ne l'empêche pas de se lancer à corps perdu dans le combat face à Machu, médusée par la fatalité dont elle est témoin.

Grâce à ses gains aux Batailles de clans, Machu prévoit de gagner la Terre avec Shuji et Nyaan. Hélas, un jour de combat, elle est coincée par Xavier. Alors que son rêve de voir la Planète bleue pourrait connaître une fin prématurée, Nyaan prend une décision.

Annqi découvre la planque de Shuji. Des informations sur le Gundam Rouge valent plus cher qu'une prime de victoire aux Batailles de clans. Machu apprend qu'Annqi compte finaliser la transaction durant la prochaine Bataille. En parallèle, la direction du renseignement de la Fédération Terrienne a vent d'informations top secrètes sur Kycilia et s'apprête à passer à l'action...

Après avoir appris les intentions d'Annqi, Machu fomente un plan d'action avec Nyaan visant à exfiltrer Shuji lors de la prochaine Bataille de clans. Hélas, leur adversaire se révélera être un tout nouveau Mobile Armor piloté par des terroristes, là pour assassiner Kycilia.

Dans les derniers instants de la Guerre d'Un An, la flotte du Sodon, sous les ordres de Char, se déploie afin de protéger la cité lunaire de Granada.

Guidée par un mystérieux message, Machu s'échappe du Sodon à bord du GQuuuuuuX, qui la mènera seule sur Terre. Après un atterrissage compliqué, elle est secourue par une mystérieuse fille retenue captive au manoir de Kabas. Machu décide de la prendre avec elle au moment de s'enfuir à bord du Core Fighter...

Le Yomagn'tho risque de mettre le monde à feu et à sang. Afin d'éviter cela, Challia Bull confie une mission à Machu : secourir la Fille de la Rose. Hélas, Kycilia leur dame le pion. Sur ses ordres, Nyaan lance la séquence d'activation de la Zeknova avec le GFreD. Sa cible : toute vie humaine sur Terre...

Machu, désireuse de secourir la Fille de la Rose, lance son GQuuuuuuX dans la bataille contre le GFreD de Nyaan. Peu après, guidée par Shuji, elle s'aventure au cœur du Yomagn'tho, où elle aperçoit Kycilia et Char...

C'est la lutte finale. Le Mobile Suit tout de blanc revêtu apparu depuis l'autre côté essaie d'attenter à la vie de Lalah. Comble de l'horreur, Shuji s'avère être aux commandes. Bien décidée à sauver Lalah, Machu forme un binôme de Mav avec Nyaan et se dresse sur la route de Shuji.