아버지가 저지른 배신의 여파로 인빈시블로서의 책임감에 고심하던 마크는 뜻밖의 적과 마주친다.

마크와 친구들에게는 여름방학이지만 슈퍼 악당들은 휴가를 떠나지 않는다. 마크는 옴니맨의 이중생활에 따른 결과를 직시해야 한다.

마크는 대학 생활을 시작하고, 데비는 개인적인 트라우마와 싸운다. 집으로 돌아온 외계인 앨런은 행성 연합이 새로운 위협에 직면한 것을 알게 된다.

마크는 외계 종족의 구원 요청에 답하지만, 그 임무는 예상치 못한 개인적인 결과를 가져온다.

마크가 예상치 못한 새로운 책임을 안고 지구로 돌아오자 그레이슨 가족은 충격을 받고, 가디언즈 오브 글로브는 국내외에서 위험에 직면한다.

두 번에 걸쳐 어려운 임무를 끝낸 가디언즈 오브 글로브는 한 팀으로 일하기 위해 고군분투하고, 마크는 영웅의 의무, 개인적인 관계, 그리고 대학생으로서의 자신의 미래 사이에서 균형을 유지하려 애쓴다.

마크가 개인적인 삶에 집중하려 하는 가운데 새로운 악당이 나타나 인빈시블에게 어느 때보다도 어려운 도전장을 내밀고, 도널드는 과거의 일로 고심한다.

오랜 적이 마크가 소중히 여기는 모든 걸 위협한다.