Face à la crise sanitaire, la nouvelle relation de Lea et Shaun est mise à l'épreuve. De son côté, Park se prépare à retourner à Phoenix, tandis que Claire tente de surmonter son chagrin.

Alors qu'ils luttent pour comprendre et devancer un virus en constante évolution, Shaun est partagé entre ses craintes quant au danger de fréquenter Lea et l'envie d'être avec la femme qu'il aime.

Avec plusieurs candidats en lice pour la résidence à Saint-Bonaventure, le Dr Lim charge Shaun, Claire et Alex d'être les mentors des meilleurs éléments de première année. Alors que leurs étudiants les suivent pour la journée, Shaun et Park discutent avec Andrews d'une opération compliquée prévue pour un mineur.

La patiente enceinte de Morgan et Shaun avec des jumeaux souffre, obligeant les médecins à se débattre avec une décision que personne ne veut prendre; Shaun demande à Lea de revenir malgré ses réserves.

Shaun s'en veut d'avoir donné de l'autonomie aux nouveaux résidents, lorsque le mauvais diagnostic de l'un d'eux a des conséquences désastreuses. Pendant ce temps, Claire, Alex et Jordan s'occupent d'une patiente dont un kyste s'est rompu, affectant des fonctions importantes de son cerveau.

Alors que le Dr Audrey Lim lutte pour faire face au choc qu'a provoqué le COVID-19, elle rencontre un jeune vétéran de guerre en proie à un syndrome post-traumatique. Après avoir discuté de son cas avec l'équipe, Claire propose un traitement radical pour l'aider. Pendant ce temps, marqué par la perte récente du patient de son étudiant, Shaun déclare qu'il ne veut plus enseigner aux nouveaux...

Le Dr Reznik découvre que la fortune de son patient et son obsession de prolonger sa vie est un dangereux mélange qui pourrait finir par lui coûter très cher. Le Dr Morgan Reznik découvre que la richesse de sa patiente et l'obsession de prolonger sa vie constituent un mélange dangereux qui pourrait finir par coûter plus que ce qu'il peut se permettre.

L'équipe soigne une jeune gymnaste qui subit les conséquences de son entraînement trop intensif. Pendant ce temps, Shaun rencontre les parents de Lea pour la première fois.

Dr Lim est confrontée au cas très particulier d'une femme enceinte atteinte d'une tumeur maligne. Par ailleurs, après avoir mal diagnostiqué un patient, Claire découvre certaines pratiques déconcertantes de l'hôpital.

Lorsque l'hôpital est frappé par une cyberattaque menaçant d'arrêter les machines qui assurent le maintien en vie des patients, Lea cherche à déjouer les hackers pour faire ses preuves.

Le Dr Glassman lance un défi aux résidents pour avoir la possibilité de le rejoindre en salle d'opération et pratiquer une technique de chirurgie inédite et compliquée. Pendant ce temps, Shaun et Morgan ne sont pas d'accord sur la façon de traiter un patient dans le comas atteint d'une tumeur cancéreuse.

Lorsqu'un chirurgien de renom vient à Saint-Bonaventure pour se faire soigner, l'enthousiasme de l'équipe est vite éclipsé par le comportement du médecin. Pendant ce temps, Shaun et Lea sont obligés de prendre une décision qui changera leur vie et le cours de leur relation.

Claire est prise au dépourvu lorsque son père qui a toujours été absent se présente à sa porte. Pendant ce temps, Shaun se sent déconnecté de Lea, ce qui provoque des tensions au sein de leur couple.

Un traitement novateur inspiré des arts martiaux interpelle l'équipe médicale, alors que Shaun (Freddie Highmore) s'inquiète car il doit pratiquer une opération sur le genou d'un instructeur de la Marine rendue délicate à cause de ses antécédents médicaux.

Lea aide deux mamans que tout oppose à trouver un terrain d'entente et bizarrement renforce sa propre confiance en tant que future mère. Andrews, Claire et Asher opèrent un des deux garçons abattus lors d'un rassemblement politique, tandis que Shaun, Lim, Park et Jordan opèrent l'autre. Claire et Asher s'affrontent sur le terrain de leurs opinions politiques.

Alors que les problèmes de grossesse de Lea (Paige Spara) préoccupent Shaun (Freddie Highmore), Asher (Noah Galvin) a du mal à honorer les derniers souhaits d'une patiente âgée.

Alors que Shaun (Freddie Highmore) risque sa carrière en contestant le travail du célèbre chirurgien qui a encadré Andrews (Hill Harper), Claire (Antonia Thomas) et Morgan (Fiona Gubelmann) sont en désaccord sur la cause et le traitement de la contraction du visage d'un sénateur américain de premier plan.

Alors qu'un accident du camping oblige Lea (Paige Spara) à prendre des mesures exceptionnelles, Lim (Christina Chang) a du mal à convaincre les parents d'une petite fille d'autoriser la chirurgie, tandis que Morgan (Fiona Gubelmann) est en désaccord avec un patient qui traite sa dépression à l'aide de champignons hallucinogènes.

Une équipe de médecins de St. Bonaventure part en mission humanitaire dans un hôpital du Guatemala.

L'équipe de l'hôpital St. Bonaventure fait face à une série de difficultés lors d'une mission humanitaire au Guatemala.