Présumé mort, Teal'c (Christopher Judge) est retrouvé vivant, mais il est sous l'influence du redoutable Apophis (Peter Williams). Les membres de SG-1 seront-ils capables d'arracher leur ami des griffes d'Apophis ? Périront-ils dans leur tentative ?

Sa mémoire ayant été altérée par Apophis, Teal'c doit entreprendre un ancien rituel pour pouvoir redécouvrir sa vraie personnalité.

Le major Carter s'évanouit en examinant un appareil extraterrestre. Pendant qu'elle se remet d'une supposée grosse fatigue, un être invisible lui rend visite et dit détenir des secrets sur l'appareil. Comment convaincre SG-1 qu'elle ne délire pas ?

De retour d'une mission violente, SG-1 découvre que le cinquième membre de l'équipe, le lieutenant Tyler, pourrait ne pas être réel. Serait-ce la fin du programme Stargate ? C'est bien ce qu'espère le colonel Simmons du Pentagone.

L'équipe SG-1 est accueillie sur K'Tau par le chef religieux de la planète, qui prend le rougeoiement du ciel apparu à leur arrivée comme un signe des dieux. Il ignore que la couleur rougeâtre annonce la destruction imminente de la planète !

Le soir de son anniversaire, Cassandra manifeste les signes d'un pouvoir : un champ électromagnétique puissant s'est déclenché à la puberté. SG-1 doit trouver un remède pour lui sauver la vie avant qu'elle ne se détruise elle-même… et le SGC !

Chaka (Dion Johnstone), l'ami Unas de Daniel, est capturé par une civilisation préindustrielle qui utilise les Unas comme esclaves. Alors qu'il essaie de libérer Chaka, Daniel risque de mettre en danger SG-1, et peut-être aussi la vie de son ami.

Le colonel O'Neil et son équipe se trouvent sur une planète inconnue, qui semble n'avoir pas été explorée depuis au moins trois mille ans. Mais au moment de quitter les lieux, Samantha Carter ramasse un paquet de cigarettes de marque russe. De retour au SG-C, O'Neill apprend que les hommes du colonel Kirinsky, ainsi qu'un archéologue, ont disparu sur cette planète.

SG-1 retourne sur Tollana pour les funérailles d'Omoc et ils découvrent que les dirigeants ont changé leur politique sur le partage des technologies et qu'ils acceptent d'échanger leurs armes avec la Terre. Mais ce geste cache-t-il quelque chose ?

SG-1 a l'opportunité de pouvoir former une alliance avec une race avancée et prête à partager sa technologie. Il s'agit des Aschens, le danger dont la version de SG-1 du futur les a alertés. Découvriront-ils la vérité avant qu'il ne soit trop tard ?

Quand le major Carter est kidnappée par un milliardaire solitaire aux intentions secrètes et mortelles, O'Neill et le reste de SG-1 doivent collaborer avec un vieil ennemi pour résoudre le mystère de sa disparition et la ramener en vie !

Un vaisseau en lien avec la capsule trouvée grâce à Martin l'extraterrestre se dirige vers la Terre. En enquêtant, SG-1 découvre que Martin est consultant pour une série de science-fiction dont l'intrigue ressemble bizarrement au programme SG !

Le colonel Jack O'Neill (Richard Dean Anderson) et ses nouvelles recrues sont la cible d'une incursion ennemie. O'Neill, blessé, doit maintenant compter sur l'équipe de néophytes pour sauver le SGC d'une invasion extraterrestre !

Sous le feu nourri de planeurs goa'ulds, Teal'c parvient à traverser la porte de justesse, mais celle-ci est détruite au même moment. SG-1 n'a que 48 h pour récupérer les données de Teal'c dans la mémoire de la porte avant qu'elle ne soit effacée.

Une trêve est déclarée entre les Goa'ulds. Les plus puissants seigneurs se rassemblent pour décider du sort de la galaxie. Comme il parle le goa'uld, Jackson est envoyé au sommet déguisé en esclave avec pour mission d'empoisonner les délégués !

Violemment assiégé, SG-1 doit glisser entre les doigts des goa'ulds qui ont juré de les éliminer pour voler le cristal qu'ils ont en leur possession. Pendant ce temps, l'équilibre de la vie est menacé par la réapparition du redoutable Anubis.

Alors qu'un astéroïde fonce vers la Terre, SG-1 utilise un vaisseau goa'uld abandonné pour poser une bombe et détruire le rocher avant l'impact. Mais le SGC perd leur signal : il semble que l'équipe n'a pas survécu et que la Terre est en danger.

Kytano, ancien prima du Goa'uld Imhotep, est maintenant le chef d'une puissante rébellion Jaffa. SG-1 visite sa forteresse dans le but de proposer une alliance. Mais O'Neill et l'équipe apprennent vite que ce partenariat pourrait leur coûter cher.

Une androïde est retrouvée endormie sur une planète déserte, et est ramenée sur Terre pour être étudiée. Une fois réactivée, elle fait preuve d'une innocence infantile. SG-1 découvre que cette innocence pourrait bien renfermer un dangereux secret.

Le colonel O'Neill (Richard Dean Anderson) demande de l'aide à deux criminels pour tenter de sauver une planète de l'invasion goa'uld. Alors qu'une attaque est imminente, le sort de la planète est entre les mains de SG-1 et de deux agents du NID.

Exposé à une dose mortelle de radiations, Daniel est mourant. SG-1 tente de le sauver, mais alors que les minutes s'écoulent, l'esprit de Daniel rend visite aux membres de l'équipe. Il leur révèle sa prochaine mission : la vie après la mort.

Toujours pas remis de la mort d'un des leurs, SG-1 met de côté son deuil pour faire face au Grand Maître Anubis. Il a capturé Thor, le chef des Asgards, pour lui extirper les secrets de leur ancienne technologie afin de dominer l'univers.