Amate, eine Highschool-Schülerin, die in einer Weltraumkolonie lebt, lernt Nyaan kennen, eine Kurierin, und gerät in die Fänge eines illegalen Schrotthändlers. Da sie die Brutalität der Militärpolizei bei der Jagd nach dem mysteriösen Mobile Suit namens "Roter Gundam" nicht ertragen kann, springt Amate in den vor ihr liegenden Mobile Suit der nächsten Generation: Den GQuuuuuuX.

Während des Einjährigen Krieges erobert Char, ein Top-Pilot der Streitkräfte des Fürstentums Zeon, auf Side 7 den neuesten Mobile Suit der Erdallianz, den "Gundam". Dadurch wendet sich das Blatt dramatisch und führt zum Sieg des Fürstentums Zeon. Doch kurz vor Kriegsende werden der Gundam und Char...

Nur widerwillig nimmt Amate an den den illegalen Mobile Suit-Duellwettbewerben, den „Clan Battles“ teil. Sie ist unsicher. Dann trifft sie Shuji, den Piloten des Roten Gundam. Amate schlägt ihm vor, sich als „MAV“ zusammenzuschließen und die Clan Battles gemeinsam zu kämpfen. Unter dem Namen „Machu“ startet Amate erneut an Bord des GQuuuuuuX ins All.

Ein Unikum, die Hexe, die im Einjährigen Krieg über 100 Feinde abgeschossen hat, tritt im Clan-Battle an, um eine alte Rechnung mit dem Roten Gundam zu begleichen. Die Verbissenheit der Hexe, die sogar ihre Familie zurücklässt, um am Mobile Suit Battle teilzunehmen, führt Machu vor Augen, wie tief menschliche Rachegelüste greifen.

Machu plant, mit dem Clan-Battle Geld zu verdienen und mit Shuji und Nyaan zur Erde zu reisen. Am Tag des Clan-Battles wird Machu jedoch von Xavier entdeckt und sitzt am Bahnhof fest. Wenn das so weitergeht, bleibt die Reise zur Erde nur ein Traum. In diesem Moment taucht Nyaan auf.

Annqi findet Shujis Versteck. Die Infos über den Roten Gundam sind mehr wert als das gesamte Preisgeld für ein Clan Battle. Machu erfährt, dass Annqi diese Informationen während eines Clan Battles verkaufen will. Der Geheimdienst der Erdföderation erfährt von Kycilias geheimen Infos und trifft eine Entscheidung.

Als Machu von Annqis Plan erfährt, denkt sie sich zusammen mit Nyaan einen Plan aus, um Shuji durch ein Clan Battle zur Flucht zu verhelfen. Aber ihr Battle-Gegner ist ein neuer Mobile Suit, der von Terroristen gesteuert wird, die Kycilia umbringen wollen.

Am Ende des Einjährigen Krieges startete die Sodon-Flotte unter Char, um zu verhindern, dass die Erdföderation die Festung Solomon zerstört und um die Mondstadt Granada zu schützen.

Eine mysteriöse Nachricht hilft Machu, von Sodon zu entkommen, und sie fliegt alleine im GQuuuuuuX zur Erde. Nach ihrer Bruchlandung wird sie von einer Frau gerettet, die als "Lady" verehrt und im Kabas-Anwesen gefangen gehalten wird. Machu beschließt, mit ihr im Core Fighter zu fliehen.

Um den Yomagn'tho von seiner Zerstörungswut abzuhalten, übernimmt Machu von Challia Bull den Auftrag, das Mädchen in der Rose retten. Doch Kycilia kommt ihr zuvor. Nyaans Mobile Suit, der GFreD, beginnt mit der Aktivierung der Zeknova-Kanone. Sein Ziel: die gesamte Menschheit auf der Erde.

Machu kämpft im GQuuuuuuX gegen Nyaan im GFreD und versucht gleichzeitig, das Rosenmädchen zu retten. Schließlich wagt sich Machu, von Shuji geführt, alleine ins Herz des Yomagn'tho. Dort trifft sie auf Char und Kycilia.

Das ist der letzte Kampf. Ein weißer Mobile Suit taucht auf und will Lalah töten. Zu Machus Schock ist der Pilot dieses Weißen Teufels niemand anderes als Shuji. Machu will Lalah unbedingt beschützen, bildet mit Nyaan einen MAV und beschließt, gegen Shuji zu kämpfen.