Desperadon päähenkilö on edellisestäkin elokuvasta tuttu El Mariachi, kiertelevä kitaransoittaja, jonka oikeaa nimeä ei kukaan tiedä. Hän haluaa kostaa tyttöystävänsä kuoleman kaikille huumekeisareille, joita Meksikosta löytyy, ja lähtee Bucho-nimisen (Joaquim De Almeida) gangsterin päänahkaa jahtaamaan. Sitä ennen Mariachi kuitenkin kohtaa uuden rakkauden Carolinan (Salma Hayek) muodossa.
IMDb 7,1/1019951 t 40 min