Vor Jahren haben mysteriöse Monster-Käfer die Menschheit fast ausgerottet und die Überlebenden haben sich auf schwebende Städte zurückgezogen. Dort, in der Sky Wizards Akademie, werden Magier ausgebildet, um sich gegen die Käfer zu wehren. Als "Team E601" kämpfen so die drei Schülerinnen in der Ausbildung, Lecty, Misora und Rico, mit ihrem Ausbilder Kanata Age gegen die Unterdrückung.
