Mandok acidentalmente liberta Niko de sua crisálida mágica. Em vez de encontrar o campeão crescido de Carondolet, a fantasmagórica princesa Lyra encontra um menino de dez anos de idade. Lyra deve guiar Niko pela Ponte da Ruína, mas quando o terrível Xerxes volta para atacar, Lyra não tem outra opção a não ser depositar sua fé em um Niko destreinado.

Lyra deve guiar Niko, Mandok e Centelha por um labirinto celeste mortal e passar pelo espantoso aractauro, enquanto um monstro feroz de três cabeças persegue o grupo. Quando a missão quase fracassa, Lyra realiza um tremendo sacrifício.

O grupo do Niko chega à Carapaça, o esconderijo perfeito, e acabam descobrindo que o voraz Saposo está no lugar da fortaleza. Chompsky, o último cidadão de Carapaça, ajuda Niko e Lyra a enfrentar a ameaça inflada e descobre um propósito melhor do que se esconder.

Os gigantes mandam Niko e Lyra para o Bosque de Quereria, onde seus maiores arrependimentos se tornam reais. Com a ajuda de Niko e de sua espada, Lyra deixa seu passado para trás. Enquanto isso, Mandok é capturado pelo inimigo.

Niko e Lyra são recebidos pelo rei Camarão e descobrem que o povo camarão está prestes a entrar em uma batalha inútil contra a feroz Mantágora para, finalmente, libertar a rainha Golfinho que foi capturada. Mandok cria uma aliança desconfortável.

Niko, Lyra e Mandok ajudam os roliços a se defender da terrível Fera Espinhenta que está aterrorizando a cidade e se aliam a um viajante misterioso.

O novo parceiro do Niko guia o grupo pelo Deserto Infinito enquanto o agente de Nar Est tenta impedi-los a todo momento. Quando o inimigo se revela, Niko deve derrotar uma ameaça interna sem a sua espada!

Aproximando-se do Lago do Destino, Niko e Lyra encontram outro humano: Aura, uma campeã que foi deixada para trás. No entanto é Niko quem fica para trás quando Lyra e Aura saem para terminar a missão sem ele.

Niko, Lyra e Mandok pousam em um veleiro nas nuvens, pertencente ao notável capitão Barba Nuvem dos piratas do céu. Eles estão prestes a serem jogados do navio, quando Nar Est envia um monstro celeste mortal atrás deles. Agora é mãos à obra.

Enquanto desciam pelos picos do perigo, uma gafe protocolar faz os Umlautis, geralmente respeitáveis, se voltarem contra os nossos heróis. Para ganhar sua liberdade, Niko deve competir contra Chacal em uma corrida desafiadora e gladiadora.

Quando um enxame de exuber-migas persegue o grupo do Niko e Lyra é picada, Niko e Mandok devem recuperar do feroz Diggantus uma poderosa armadura que está escondida no subterrâneo!

Niko e Lyra enfrentam Nar Est em seu território. No entanto, o confronto final de Niko, não sai como planejado.

Niko lidera o exército da luz em uma batalha final acirrada e descobre o verdadeiro poder por trás de Nar Est.