Le général O'Neill parti à la retraite, le lieutenant-colonel Cameron Mitchell et le général Landry prennent le commandement du SG-1. Cameron se fait une joie de faire équipe avec les membres de la mission, mais il découvre que Carter travaille sur la Zone 51, que Teal'c est retourné près de son peuple et que Daniel Jackson s'apprête à rejoindre Atlantis.

Dans le sanctuaire du roi Arthur, Vala, Jackson, Cameron et Teal'c sont en fâcheuse posture. Mais ils parviennent à résoudre les énigmes et à trouver le trésor d'Avalon. Ils découvrent également un livre qui leur apprend que les ancêtres des Anciens sont les Altérans qui vivaient dans une galaxie dominée par les Oris.

Aux confins de la galaxie, Daniel rencontre Doci, le grand prêtre Ori, dont la destinée est d'amener les humains à l'Illumination, les impies étant opprimés. Maintenant que ces redoutables religieux ont découvert leur existence, des prêcheurs Ori sont envoyés dans la galaxie pour convertir des populations entières et déclarer la guerre aux Infidèles.

Afin de défaire les liens psychiques qui les unissent toujours une fois les bracelets Jafa retirés, Daniel et Vala, escortés par Cameron et Teal'c, rendent visite au dernier propriétaire des bijoux pour qu'il rompe le charme.

Quand Daniel et Vala tentent de défaire les enseignements des Oris sur une autre planète, ils sont soumis, au même titre que les habitants, au terrible courroux de leurs ennemis. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Nerus, chef Go'auld, prévient le colonel Landry de l'invasion imminente des Oris par l'intermédiaire d'une planète jaffa dont l'ennemi bloque la Porte des étoiles grâce à un champ magnétique. Autorisé par le gouvernement américain à utiliser la plus puissante des armes nucléaires à leur disposition, Sam Carter embarque à bord du Prométhée…

SG-1 découvre que Ba'al s'est installé sur Terre et dirige une grande entreprise. L'équipe doit naviguer entre les enjeux politiques et les menaces extraterrestres pour neutraliser cette nouvelle infiltration.

Le lieutenant-colonel Cameron Mitchell disparaît en tentant de contacter les Sodans, un groupe de Jaffas qui ont échappé au joug des Goa'ulds et ont colonisé leur propre planète. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Hank Landry (Beau Bridges) et ses supérieurs sont en désaccord sur ce qu'ils doivent faire de ce qu'ils ont trouvé dans un labo : une création génétiquement modifiée par Anubis. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Alors que SG-1 tente d'empêcher la propagation d'un virus mortel causé par les perfides Oris, Gerak tente de convertir le reste des Jaffas en fidèles de la religion d'Origine. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Alors que le Jaffa Gerak rassemble ses forces contre eux, l'équipe SG-1 doit trouver un antidote contre l'épidémie mortelle des Oris avant qu'elle ne se répande mondialement. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Les choses se compliquent pour SG-1 quand le lieutenant-colonel Cameron Mitchell est victime d'une dangereuse technologie qui permet aux gens de partager leurs souvenirs. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

En raison d'un dysfonctionnement de la Porte des étoiles, plusieurs réalités parviennent simultanément aux commandes du vaisseau et sèment le trouble en créant différentes versions de l'équipe de SG-1.

Daniel s'inquiète quand Teal'c disparaît soudainement en enquêtant sur de la corruption. Ses peurs sont confirmées quand il apprend que des Jaffas sont enlevés et endoctrinés. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

SG-1 part détruire une gigantesque arme dévastatrice inventée par leurs puissants ennemis, les Oris, qui menace d'annihiler la Fédération calédonienne et son peuple. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Hank Landry (Beau Bridges) et le reste de l'équipe SG-1 préparent une offensive en apprenant que le Goa'uld Ba'al est aux États-Unis et qu'il regagne du pouvoir. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Des insectes génétiquement modifiés deviennent avides de chair humaine, forçant SG-1 à les détruire avant qu'eux et les diplomates internationaux en visite n'en soient victimes. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Alors que Teal'c part enquêter sur une planète Jaffa, Mitchell, Carter et Daniel sont "déphasés" en testant une très puissante machine ancienne. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.

Le SG-1 est averti par Vala que les Oris s'apprêtent à lancer leur invasion. Ils construisent des vaisseaux de guerre et persuadent leurs fidèles de se préparer à une gigantesque croisade interstellaire.

Alors que l'armée des Oris approche, le lieutenant-colonel Cameron Mitchell et Daniel Jackson cherchent désespérément un appareil qui détruira leurs ennemis pour de bon. Avec Ben Browder, Michael Shanks, Amanda Tapping et Christopher Judge.