NCIS

在第12季的首集中，華盛頓特區的團隊發動手頭的所有資源和聯邦機構內的所有聯繫人，設法找到失蹤的團隊成員。

一名海軍上尉在與總統私下會面的路上被殺，海軍罪案調查處團隊需要判斷他是因為近期頻發的蒙面搶劫而被殺，還是為了保護情報機密而被殺害。

在海軍罪案調查處負責的一個案件中，線索指向達奇多年未聯繫的幼年好友，於是，他和特別探員畢夏普動身前往倫敦，向這位好友的家人和同事了解情況。

一名海軍研究科學家遭到謀殺，而首要嫌疑人卻是俄羅斯政府的通緝犯。於是海軍部長安排海軍罪案調查處團隊與聯合反恐部隊共同破案。

海岸警衛隊和海軍罪案調查處在海上完成聯合培訓演習時，吉布斯和海岸警衛隊探員波林發現海裡漂浮著一具男屍，而他居然是60海里外一艘船上失蹤的船員。

一位海軍中校的妻子遭到謀殺，死者生前是一位心理醫生。海軍罪案調查處在“聖戰”組織的刺殺名單上發現了這位中校的名字，於是他們需要調查，死者究竟是因為職業原因被殺，還是與恐怖分子有關。

一位退役的二級軍士長遭到謀殺，在對本案的調查過程中，海軍罪案調查處發現了一個假冒的慈善組織，他們假裝幫助失蹤軍人的家人搜尋這些人員，以此騙取錢財。與此同時，畢夏普對自己試用期的評估結果感到非常擔心。

一起肇事逃逸事故導致一名軍務長死亡，海軍罪案調查處團隊對此案的起因開展調查。一名海軍醫務兵曾兩次去阿富汗服役，回國之後，她被指控向車禍受害者非法提供醫療救助。吉布斯則設法幫助她撤銷指控。

受到糟糕的天氣影響，迪諾佐、畢夏普和她的丈夫傑克被困在了杜勒斯機場。而在感恩節出行高峰期，東北部機場的恐怖襲擊威脅則開始升級，於是一行人開始調查這個由海軍罪案調查處負責的案子。

耶誕節前一周，全城出現了斷網事件，海軍罪案調查處團隊就該事件向三名在押的網路恐怖分子了解情況。此外，米基在思考案子和吉布斯眾所周知的規定時，給父親寫了一封表達心聲的信。

海軍罪案調查處團隊負責調查的一系列罪案現場似乎都在刻意模仿之前的案子。此外，吉布斯的兩個前妻也出現在了一個罪案現場，與他討論重要事宜，而團隊從未見過其中一個前妻。

敘利亞的一次救援行動顯示，一名美國人參與綁架了一位社工，於是海軍罪案調查處團隊開始抓捕在美國土生土長的這名恐怖分子。

一名海軍上尉即將成為首位獲得榮譽勳章的公開出櫃男同性戀軍人之際卻遭到了謀殺，海軍罪案調查處團隊對此案開展調查。此外，隨著妻子的臨產期將至，馬上要成為父親的派莫開始籌備海軍罪案調查處式的出生前派對。

在一名軍校畢業的陸戰隊員被謀殺，手中緊握著一名在學學生的照片時，狄諾佐回到了年輕時曾唸過的軍校。畢夏和她丈夫邀請吉布斯和團隊成員出去吃一頓特別的晚餐。

海軍罪案調查處團隊懷疑吉布斯的死對頭是全球反恐峰會爆炸案的背後主使，但吉布斯選擇不參與此案調查，而是去幫助悲傷欲絕的福奈爾。福奈爾的妻子遭到謀殺後，福奈爾的精神幾近崩潰。

一宗謀殺案的受害者居然一直活著，而他使用的化名正是吉布斯20年前在一個案件中所使用臥底的身分。

海軍罪案調查處正在調查一宗謀殺案，案件證據顯示，出借的一副稀有畫作被調包成了贗品。此時，迪諾佐只得向團隊透露自己對藝術品黑市的了解，並提供了幾個聯繫人。

一名小偷的屍體出現在一位海軍陸戰隊員的家中，海軍罪案調查處在調查過程中發現一個恐怖組織的名片，這正是狄萊和國防部此前追蹤的那個恐怖組織。

軍務長謀殺案件引出了40年前的機場爆炸案線索。這個當年調查未果的舊案正是吉布斯和迪諾佐過去兩年間分配到的案子。

海軍罪案調查處正在調查一宗案件，證據顯示，兇手所使用的兇器正是美國煙酒槍炮及爆炸物管理局“速度與激情行動”中購買的武器，這一釣魚執法行動當時備受爭議。於是，迪諾佐在本集中與他的女友，也就是美國煙酒槍炮及爆炸物管理局特別探員佐伊濟慈展開了合作。

在調查華盛頓特區一位海軍陸戰隊員的謀殺案時，線索指向海外的一個恐怖組織，這個組織手中還有另一名海軍陸戰隊員作為人質，於是吉布斯和畢夏普奔赴阿富汗開展調查。

在海軍情報局工作的一名海軍少尉遭到謀殺，海軍罪案調查處網路行動小組的特別探員奈德唐納格協助調查。馬特瓊斯和傑米班柏客串了本集。

在《海軍罪案調查處》第12季的最後一集中，國外發生的一起爆炸案導致多人死亡，其中包括海軍罪案調查處團隊中的一員，這讓整個團隊都陷入了悲傷之中，於是他們開始調查這個通過互聯網招募青少年加入的全球恐怖組織，誓將兇手繩之以法。

在《海軍罪案調查處》第12季的最後一集中，國外發生的一起爆炸案導致多人死亡，其中包括海軍罪案調查處團隊中的一員，這讓整個團隊都陷入了悲傷之中，於是他們開始調查這個通過互聯網招募青少年加入的全球恐怖組織，誓將兇手繩之以法。