Alors que tout le monde croit Ziva morte, Tony et Mc Gee sont convaincus qu’elle est retenue prisonnière quelque part, et qu’elle ne peut pas communiquer avec eux. Gibbs leur demande de recruter une remplaçante, mais ils manquent de motivations. Ils décident de demander à Gibbs d’organiser une mission pour partir à la recherche de Ziva.

Un sergent des marines et deux civils sont retrouvés morts dans une chambre d’hôtel. Ziva, libérée de sa captivité, est de retour et souhaite réintégrer le NCIS. Gibbs a quelques hésitations.

Matt Burns, qui accuse sur internet le NCIS d’avoir couvert un meurtre, est assassiné. Alors que le lieutenant de police Sportelli est chargé de l’enquête et refuse de coopérer avec Gibbs, le NCIS se voit contraint de reprendre le dossier sur la mort déclarée accidentelle du lieutenant Arnett, remise en question par Burns. Alors qu’Abby et Ducky refont leurs analyses, sans la dépouille...

Des pêcheurs de crevettes prennent dans leurs filets le corps d’un Marine, le sergent chef Daniel Cryer. Le NCIS s’occupe de mener l’enquête pour découvrir comment il a pu se retrouver ici. Leurs investigations les conduisent très vite à en déduire que Ziva n’est pas totalement étrangère à cette affaire. Vance et Gibbs décident de l’interroger

La veille d’Halloween, un marine qui venait de rentrer d’Afghanistan est retrouvé mort devant chez lui, dans sa voiture. Meurtre ? Suicide ? Le NCIS découvre que sa passion pour les farces et attrapes ne lui a pas fait que des amis. Ducky et Abby trouvent les preuves qu’il s’agit bien d’un meurtre. L’enquête conduit Gibbs et son équipe sur les traces de sa veuve, puis du sergent de son unité...

Un bateau s’échoue sur une plage du Mexique avec à son bord les cadavres de deux hommes. Le NCIS est appelé pour mener l’enquête. Très vite on découvre que les deux hommes sont deux anciens militaires, et les soupçons de l’équipe se portent sur Mike Franks, un ancien des NCIS. Gibbs part a la recherche de Mike, et tente de découvrir pourquoi il a tué ces deux hommes.

Un médecin civil est retrouvé mort sur un terrain d’entrainement de la Navy, et le directeur Vance est persuadé qu’il s’agit de l’œuvre de Lee Wuan Kaï, une espionne Nord Coréenne qu’il traque depuis presque 20 ans et qui vient d’échapper au NCIS de Los Angeles. Ses soupçons sont confirmés après la tentative d’assassinat d’un ancien militaire Nord coréen. Pendant ce temps là, McGee croit avoir...

Washington est pratiquement plongée dans le noir suite à une panne de courant liée à une attaque à main armée chez Swift Cast, un fournisseur d’accès Internet. Emma Paxton, lieutenant dans la Navy, est retrouvée morte sur les lieux. Pourquoi un lieutenant de la Navy participait à un braquage?

Thanksgiving approche et Ducky souhaite recevoir toute l’équipe chez lui, mais chacun a déjà d’autres projets et décline l’invitation. Entre temps, le corps du caporal Trevor Lozada est retrouvé dans un champ de maïs, avec une main sectionnée, signe d’appartenance au gang PC. L’équipe du NCIS démarre son enquête à l’institut Sattler, spécialisé dans l’étude et l’analyse des stratégies, où...

Le lieutenant Thomas Ellis, du corps des marines, est retrouvé mort pieds nus dans la neige peu avant Nöel. Le père de Gibbs rend visite à son fils pour les fêtes. Thomas s’était converti à l’islam, ce qui ne plaisait pas à tout le monde. Même son père, colonel à la retraite devenu pasteur, voyait cela d’un mauvais œil. Le père de Gibbs est en souffrance. Que s’est il récemment passé dans sa vie?

Le capitaine de corvette Sayers, un pilote d’essai de la Navy est retrouvé mort à demi carbonisé dans la forêt. Mc Gee établit que son jetpack a explosé. L’enquête conduit Gibbs et son équipe chez les Tillman, ex-époux et principaux concurrents sur le marché des propulseurs personnels, pour qui Sayers effectuait des vols d’essai. Mais M. Allison Hart, une avocate qui se met à leur service,...

Un attentat à la voiture piégée a fait un mort sur le tarmac de la base aérienne de Pax River. L’équipe du NCIS est appelée pour enquêter et assurer la protection du prince Saoudien Sayif Ibn Alwaan, qui avait loué ce véhicule pour tout le temps de son séjour sur le sol américain. Le père de Dinozzo lui rend visite, sans le prévenir, alors que les deux hommes ne se sont pas vus depuis très...

Tony et Ziva doivent protéger Nora dans l’avion qui les mènera de Paris à Washington afin qu’elle témoigne contre son patron dans une affaire de fraude. Gibbs découvre qu’un contrat d’assassinat a été lancé contre elle. Le tueur est dans l’avion, mais qui est-ce?

Un marine est retrouvé mort après l’explosion de sa voiture qui s’avère être radioactive. Le NCIS découvre l’existence d’une menace terroriste à la bombe sale sur Washington alors que Vance doit témoigner devant le Sénat avant le vote du budget très controversé de la Défense. Gibbs se retrouve en présence de M. Allison Hart, qui ne cesse d’entraver son enquête. L’état d’urgence est décrété à...

L’ex caporal Damon Werth demande à Gibbs de l’aider à éclaircir le meurtre de son ami Heatherton. L’équipe du NCIS part en chasse pour coincer un transporteur routier soupçonné de trafic en tout genre. Damon et Ziva prennent la route à bord d’un camion vide en vue d’un détournement de marchandise. Mais quelle genre de marchandise?

Gibbs et son équipe doivent enquêter sur le meurtre du Capitaine de la Navy, Joseph Norton, tué de trois balles, alors qu’il rentrait chez lui par le front de mer. Trois témoins ont assisté au meurtre, un couple qui promenait son bébé pour l’endormir, et Joann Fielding, la fiancée du capitaine, qui n’est autre que l’ex belle mère de Gibbs. Une enquête qui ne s’annonce pas facile, vu les...

Gibbs et son équipe enquêtent sur un Marine retrouvé criblé de balles, porté disparu au cours d’une mission secrète en Afghanistan six ans plus tôt. Il s’avère qu’il vivait depuis à Washington sous une fausse identité. Le lieutenant Mayne, devenu Christian Wells, riche courtier, meurt sans avoir parlé. L’enquête révèle qu’en Afghanistan, les Marines Mayne, Holcomb et Gontz ont volé l’argent...

Un cadavre est retrouvé sur la plage. Il s’agit du lieutenant Jensen, maître plongeur de la Navy. Abigail Borin, des garde côtes, enquête aussi sur l’affaire. Elle est à la recherche du meurtrier de Martin Lime, capitaine du Delilah. Joseph Mavrey, médecin renommé, s’avère être à la recherche du trésor du Calafuego, un navire espagnol ayant sombré au large de la Virginie au XVII ème siècle....

Le lieutenant Justin Moss est retrouvé mort alors qu'il traversait une route pour rentrer chez lui. Il a été poignardé. Sa femme déclare aux agents du NCIS qu'il menait une enquête sur les réseaux d'escort girls, pour le journal pour lequel il travaillait. Il avait rendez vous ce jour là avec une de ces filles. Très vite, l'équipe de Gibbs découvre que la fille en question est une certaine...

Le quartier maître Scott Roebuck est retrouvé mort , jeté à la mer après avoir été tué de deux balles dans la tête. Une autre victime est retrouvée pas très loin de lui, un certain Delmar, qui devait témoigner devant le tribunal, dans une affaire contre la pègre, et qui avait refusé une protection policière. Le FBI exige que Gibbs mène son enquête en duo avec Farnell, un de leurs agents.

Gibbs et son équipe enquêtent sur la mort du lieutenant Jeffrey Hutton, retrouvé mort de cause inconnue devant un hôpital. Sa soeur Dana, journaliste à ZNN, est introuvable. Elle a disparu après la mort de Charley Bascom, un vieil ami libraire qui a fait d’elle son exécutrice testamentaire. Tony est obsédé par Dana. Ses recherches le conduisent à ZNN, chez Dana et à la librairie de Bascom,...

Un cadavre amputé des 2 pieds est découvert dans une casse auto, il s’agit du caporal Collins, des marines. Abby est envoyée au Mexique pour donner un cours lors d’un séminaire sur le médico légal. Elle travaille dans ce cadre sur une affaire ancienne de vingt ans, l’assassinat de Pedro Hernandez, un trafiquant de drogue. Concernant le meurtre de Collins, la piste s’oriente vers un tueur en...

L'équipe du NCIS est appelé sur la plage pour enquêter sur un cadavre retrouvé calciné. Très vite, ils comprennent qu'il s'agit du corps de l'agent Lara Macy. Cette dernière enquêtait sur le viol subi par le second maître Kaylen Burrows, et elle venait de quitter Marseille pour revenir aux Etats Unis. L'équipe se lance à la recherche du violeur du second maître, qui selon eux aurait pu tuer...

Gibbs est enlevé par Paloma Reynosa, qui dirige le cartel du même nom au Mexique. Elle veut se venger de lui, elle lui reproche d'avoir tué son père. Et afin de l'obliger à travailler pour elle, elle le menace de tuer l'une après l'autre, toutes les personnes chères à Gibbs, à commencer par le père de ce dernier. Gibbs se rend compte très rapidement que Rivera, l'agent avec lequel travaille le...