Shiki, Rebecca et Happy et leurs amis continuent d'explorer la galaxie à la recherche de Mother, la déesse de l'univers. Mais Drakkhen Joe, l'alchimiste des Ténèbres, est bien décidé à s'emparer de l'Edens Zero. Pour contrer cet ennemi redoutable, ils organisent une infiltration audacieuse à bord de son cuirassé. De terribles affrontements sont sur le point d'éclater…
