Mandok libera inavvertitamente Niko dalla sua Crisalide. Invece di un Campione adulto, la principessa Lyra si ritrova di fronte a un bambino di dieci anni, che dovrà condurre al Ponte del Destino. Tuttavia, con il ritorno di Xerxes, Lyra non può che affidare il proprio destino nelle mani dell'inesperto Niko.

Lyra deve guidare Niko, Mandok e Flicker attraverso un pericolosissimo labirinto e superare il terribile Aractauro, mentre vengono inseguiti da un orribile mostro a tre teste. Proprio quando tutto sta quasi per andare in fumo, Lyra decide di compiere un enorme sacrificio.

La squadra di Niko raggiunge Carapace, che dovrebbe essere il perfetto nascondiglio. Lì però troveranno il vorace Mugwhump. Chompsky, l'ultimo cittadino di Carapace, aiuta Niko e Lyra ad affrontare questa grande minaccia e a trovare uno obiettivo migliore rispetto al nascondersi.

Le Colline dei Giganti mandano Niko e Lyra nella Foresta dell'avrebbedovutoessere, dove i loro più grandi rimpianti prendono vita. Con l'aiuto di Niko e della sua Spada, Lyra riesce a lasciarsi il passato alle spalle. Nel frattempo Mandok viene catturato da un nemico.

Niko e Lyra vengono ricevuti da Re Scampo e scoprono che i Gamberi stanno per iniziare una futile battaglia contro il malvagio Mantagore al fine di liberare la Regina Delfina. Mandok stringe una pericolosa alleanza.

Niko, Lyra e Mandok aiutano i Rototombi a sconfiggere il terribile Serpecactus che semina il panico in città e uniscono le forze con un misterioso viandante.

Con l'aiuto del nuovo assistente, la squadra attraversa la Distesa Sconfinata, ma viene continuamente ostacolata da una spia di Nar Est. Quando finalmente il nemico si rivela, Niko dovrà affrontarlo senza la sua Spada.

Sempre più vicini alle Pozze del Destino, Niko e Lyra trovano un altro essere umano: Aura, un'ex campionessa. Lyra e Aura se ne vanno, lasciando Niko da parte.

Niko, Lyra e Mandok finiscono tra le nuvole del famoso Capitano Nimbeard dei Pirati del Cielo. Proprio mentre stanno per essere buttati giù dalla tavola, Nar Est manda un orribile mostro e tutti dovranno attivarsi per sconfiggerlo.

Ai Picchi del Pericolo, gli Umlauti sono molto arrabbiati con i nostri eroi perché hanno violato un protocollo. Per ottenere la sua libertà, Niko deve competere contro Jackal in una gara entusiasmante.

Le Brioformiche inseguono i nostri eroi e Lyra viene morsa. Niko e Mandok devono recuperare una potente armatura nascosta sottoterra dal feroce scavanto.

Niko e Lyra affrontano Nar Est nella sua dimora. La resa dei conti, però, non sarà facile come previsto.

Niko conduce l'Esercito della Luce nello scontro finale e svela il vero potere dietro Nar Est.