Stargate Atlantis

Quand Atlantis désactive la gravité artificielle et les boucliers pour corriger les dégâts subis par le réseau électrique, Rodney éteint toutes les fonctions accessoires.

Ayant remédié temporairement au problème d'énergie, l'expédition se prépare à une mission risquée pour récupérer un ZPM.

Ronon retrouve de vieux amis : un groupe de Satedans qui entraîne l'équipe Atlantis dans une périlleuse mission contre les Wraith. Pendant ce temps, le colonel Carter arrive en leader sur Atlantis et prend ses nouvelles fonctions au sein de la cité.

Sheppard réveille accidentellement une forme de vie cristalline qui désire éliminer le reste de l'expédition en envahissant leurs cauchemars sous la forme de Sheppard.

Alors qu'il rentre de mission, le major Sheppard se fait enlever à bord de son jumper par un vaisseau technologiquement avancé dont les occupants se font appeler « les voyageurs ». Qu'attendent-ils de Sheppard ?

Un virus contamine tous les membres de l'expédition. Les premiers symptômes sont des maux de tête et des vertiges jusqu'à la perte de mémoire totale. Seuls Teyla et Ronon sont épargnés. Mais sauver leurs amis s'avère une tâche bien difficile.

Lors d'une visite au Nouvel Athos, Teyla et le docteur se retrouvent à la merci d'une tribu primitive de guerriers.

Teyla part à la recherche de son peuple et rencontre Davos, un mystérieux médium qui prédit un avenir sombre pour Atlantis. Shepard se voit obligé de s'allier avec les Wraith pour contrer les plans des Replicateurs.

L'équipe d'Atlantis retourne sur Terre pour retrouver la soeur de McKay, qui vient d'être kidnappée. Sheppard et Ronon se rendent compte que tout cela pourrait avoir un rapport avec les Replicateurs.

Les plus grandes peurs de l'expédition se réalisent : la cité percute un étrange drone et les Réplicateurs la localisent. Lorsque Elizabeth Weir réapparait, l'équipe se rend compte que quelque chose ne va pas.

Les Réplicateurs continuent d’exterminer toutes les ressources alimentaires des Wraiths, mais l'équipe d'Atlantis dispose désormais de moyens suffisants pour suivre leurs vaisseaux.

Une alliance éphémère lance une attaque sur la flotte des Réplicateurs, tandis qu'un groupe de Wraiths tente de récupérer unE2PZ sur une planète voisine.

Une alerte censée être celle d'une épidémie s'active et toutes les portes de la cité se ferment. Il est clair que cette quarantaine de catégorie 5, lancée automatiquement par la cité n’est pas prête d'être levée. McKay, la seule personne capable de lever ce confinement forcé, est coincé dans la serre de Brown, hors de portée du moindre ordinateur.

Sheppard et McKay doivent protéger Harmony, jeune princesse d'une planète de la galaxie de Pégase qui commerce régulièrement avec l'expédition Atlantis. Cette dernière effectue son pèlerinage avant d'être reine mais, de dangereux ennemis sont à ses trousses.

Sheppard retourne sur Terre pour assister à l'enterrement de son père, décédé d’une crise cardiaque. Peu de temps après, il fait la connaissance d'une jeune scientifique, Ava Dixon, membre du projet secret Archétype, qui lui demande de l’aider à retrouver le Réplicateur humanoïde qu’elle a créé.

McKay, Carter et le Dr Keller se rendent sur la planète M5V-801 pour venir en aide aux habitants, qui ont établi leur campement sur un terrain minier en proie à de violents séismes.

La station Midway est envahie par un groupe de Wraiths. Ronon et Teal'c tentent de les neutraliser. La tension monte lorsque les Wraiths découvrent le code leur permettant d'accéder de voyager sur Terre.

Alors qu'une mystérieuse maladie balaie la galaxie de Pégase, Teyla a une vision de Kanaan, qui lui transmet un message. Elle tente alors de joindre Sheppard, parti en mission, pour le mettre au courant de la situation.

Après avoir retrouvé quelques-uns des Athosians disparus, Teyla cherche à s'échapper. Toute l'équipe d'Atlantis est surprise quand un ancien ami, que tout le monde croyait mort, réapparaît miraculeusement.

Sheppard retourne sur Atlantis après une mission et trouve la cité abandonnée et tous les systèmes éteints. A la place de l'océan, Atlantis se trouve entourée de dunes de sable à perte de vue.