Naruto Shippuden

Orochimaru comienza a agonizar con un gran dolor y necesita medicinas del nivel diez para mantener su cuerpo. Incluso en este estado, comienza los preparativos para el ritual de transferencia y Kabuto comienza a sentir el potencial futuro de Orochimaru. Sasuke también comienza a presentir lo que se acerca y es momento de que se enfrente a su mentor...

Orochimaru hace su cuerpo pedazos y se convierte en una serpiente blanca. Mientras ataca a Sasuke para obtener su cuerpo, Orochimaru comienza a tener recuerdos de cuando encontró los restos de piel de una serpiente frente a la tumba de sus padres. Guiado por su deseo de obtener el Sharingan, Orochimaru finalmente le arrebata la libertad a Sasuke...

Después de que derrota a Orochimaru, Sasuke libera a Suigetsu quién estaba atrapado en un tanque de agua. Sasuke le dice que se una a él pero Suigetsu no es tan fácil de convencer...

Sasuke y Suigetsu se dirigen a la guarida del sur para reclutar a Karin en su grupo. Suigetsu queda sorprendido por la poca seguridad del escondite pero le cuentan que, gracias a las habilidades de Karin, nadie puede escapar del lugar. ¿Qué clase de poderes tendrá Karin que le permiten tener ese tipo de control del lugar?

Sasuke y su equipo se dirigen hacia el escondite del norte para reclutar a Jugo. En el camino Karin les explica que en ese lugar se realizan todo tipo de experimentos en humanos. Jugo, en particular, es un ninja con anormales impulsos homicidas, y es el responsable de las enzimas que crean la marca del sello maldito de Orochimaru...

Abriéndose paso por el disturbio, Sasuke llega a la celda de Jugo, pero este se rehúsa a salir de allí. Jugo le dice a Sasuke que prefiere morir en soledad que dejar su celda y la guarida.

Diez años atrás, el gobierno que mantenía unidas a las Cinco Grandes Naciones Ninja se volvió inestable y todo el mundo cayó en un gran conflicto llamado La Tercera Gran Guerra Ninja. Minato Namikaze, quien sería el cuarto Hokage en el futuro, le asigna a Kakashi, Obito, del clan Uchiha, y Rin, un ninja médico, una misión en el Puente Kannabi...

Ignorando la orden de Kakashi de seguir con la misión, Obito se dirige a rescatar a Rin quien fue secuestrada por los Ninjas de la Roca. El enemigo detecta a Obito, lo atacan y en el último minuto es salvado por Kakashi...

Después de que Itachi y Kisame cazan al Yonbi, el líder del Akatsuki los convoca para una reunión en donde anuncia la muerte de Orochimaru y que Sasuke, su asesino, posiblemente les esté echando el ojo como objetivo...

Bajo las órdenes de Kakashi, los ninjas de Konoha se dirigen a buscar a Itachi. Los perros ninja de Kakashi les ayudan a recoger la mayor información posible sobre él. Mientras, los miembros de Hebi también buscan información de su paradero, y Sakura se encuentra con Karin cuando uno de los sabuesos detecta el rastro de Sasuke y la guían hacia él.

Sasuke y Deidara se encuentran, y enseguida comienza la batalla. Después de intercambiar varios golpes para medir las fuerzas de Sasuke, Deidara conjura su gran dragón de arcilla, y desde lo alto empieza a lanzar intensos ataques a Sasuke.

Deidara está determinado a destruir el Sharingan para quitarse la amargura que siente debido a una antigua derrota contra de Itachi, así que libera su gran ataque, el C4 Karura, que fue creado para matarlo. Esta temible arma es capaz de destruir a cualquier ser vivo desde dentro usando millones de nano-bombas. ¿Podrá Sasuke escapar de este ataque?

Después del enfrentamiento con Deidara y su técnica suicida, Sasuke desaparece y los demás miembros del Hebi se apresuran a buscarlo en el último lugar en donde sintieron su presencia... ¿Qué habrán encontrado en ese lugar?

La ninja de Konoha le informa a los demás mientras los miembros del Hebi se van rápidamente del hotel. Para asegurarse de que Sasuke se concentre en su próxima batalla con Itachi, a Karin se le ocurre una gran idea para mantener a los ninja de Konoha ocupados.

Durante el reinado del Segundo Hokage, el joven Jiraiya, Orochimaru, y Tsunade son asignados al pelotón de Hiruzen Sarutobi como genins. Después de presenciar el Jutsu de Invocación de Sarutobi, Jiraiya queda fascinado y se propone dominar la técnica de teletransportación.

La misión de Jiraiya de buscar un estudiante es interrumpida por el comienzo de la Tercera Gran Guerra Ninja. Jiraiya se une a Tsunade y Orochimaru en la batalla contra la Aldea Oculta de la Lluvia.

Dentro del sapo Gamagoro, Jiraiya logra infiltrarse dentro de la Aldea Oculta de la Lluvia, y mientras va reuniendo información, no encuentra ningún indicio de que haya ocurrido ninguna guerra civil dentro de la aldea.

Prediciendo una posible batalla, Jiraiya toma medidas y libera al Sapo Pergamino que guarda la llave del sello que contiene al Zorro de Nueve Colas dentro de Naruto.

Jiraiya se enfrenta en batalla con su antiguo alumno Pain, que como miembro del Akatsuki, está siendo impulsado por ideales retorcidos.

Ahora, combatiendo a tres Pain, Jiraiya es forzado a completar su modo Ermitaño para derrotarlos.

Jiraiya ha perdido su brazo y es superado por el poder de los seis Pain que han aparecido ante él. De esos seis se revela la identidad de Tendo, quién en realidad es Yahiko, uno de los antiguos estudiantes de Jiraiya. Él sigue tratando de descubrir los verdaderos poderes del Rinnengan, pero es forzado a luchar una vez más.

Siguiendo a su hermano, Sasuke llega a una de las guaridas del Akatsuki, pero cuando está a punto de entrar, Itachi finalmente aparece ante él...

Mientras Itachi espera por Sasuke en el escondite Uchiha, él comienza a recordar el incidente que lo llevó a traicionar a Konoha. Cuando Sasukefinalmentee llega al lugar, la batalla comienza entre los dos hermanos...

Seguido de la feroz batalla de genjutsu entre los dos Sharingans de los hermanos, Itachi comienza a explicar el secreto detrás del más poderoso jutsu ocular, el Mangekyo Sharingan, y la historia del clan Uchiha...