इस सीरीज़ में मेसन केन और नाडिया सिंह, सिटाडेल नाम के जासूसी संगठन के टॉप जासूस हैं। जिनका सामना एक बहुत ही खतरनाक नए सिंडिकेट, मैंटीकोर से होता है जो कुछ भयानक करने वाला है। आठ साल से मेसन केन अपनी याददाश्त खोकर काइल कॉनरॉय नाम से अपनी जिंदगी जी रहा है। एक दिन उसका पुराना साथी उसकी मदद मांगता है ताकि वह ताकतवर बन चुके मैंटीकोर को दुनिया में तबाही मचाने से रोक सके।

इससे पहले कि देर हो जाए, काइल और बर्नार्ड न्यू यॉर्क जाते हैं, सिटाडेल एक्स केस को मैंटीकोर के मुख्यालय से चुराने के लिए। फिर काइल को पता चलता है कि उसके अतीत से कोई ज़िंदा है और वह सब कुछ दाव पर लगाकर उसे ढूंढ़ने निकल पड़ता है।

काइल और नाडिया एक पुराने सेफ हाउस में पहुंचते हैं, जहाँ उनके अतीत की छोटी-छोटी झलकियां उनके सामने आती हैं। जल्दी ही उन्हें पता चलता है कि उनका एक पुराना साथी जो मैंटीकोर को रोकने में कारगर साबित हो सकता है, मोरोक्को में कैद है। उसे बचाने के लिए उन्हें एक लोकल माफिया की मदद लेनी होगी। लेकिन उनका मिशन खतरे में आ जाता है, जब उनके अतीत के कुछ राज़ खुलते हैं।

ऐबी की पिछली पहचान सामने आने पर हमें मेसन, नाडिया और सेलेस्ट की उलझनें और उनके बीच के रिश्तों और उनसे जुड़े रहस्यों के बारे में पता चलता है। साथ ही, वर्तमान में नाडिया और काइल मोरोक्को में मैंटीकोर के कंपाउंड में पहुंचते हैं और अपनी जान जोख़िम में डालकर अपने पुराने साथी को बचाते हैं। लेकिन उसे बचाने पर उन्हें शाबाशी नहीं मिलती बल्कि दोनों में से एक के ऊपर आरोप लगाया जाता है।

नाडिया, काइल और कार्टर को मैंटीकोर से बचने और एक्स केस सुरक्षित रखने के लिए एक साथ काम करने पर मजबूर किया जाता है। पर उनमें से एक के ऊपर शक़ इतना ज्यादा बढ़ जाता है कि उसका अंजाम बहुत बुरा होता है।

इस सीज़न के आख़िरी एपिसोड में जब उनका अपना ही साथी मैंटीकोर द्वारा कैद कर लिया जाता है, तो काइल, नाडिया और कार्टर, सब कुछ दाव पर लगाकर उसे बचाते हैं और मैंटीकोर के न्यूक्लियर हथियार पाने के प्लान को नाकाम कर देते हैं।आखिर में उस धोखेबाज का भी पता चल जाता है, जिसने सिटाडेल को धोखा दिया था और यह भी सामने आता है कि अब तक जो भी उन्हें पता है वो सब झूठ है।