シーズン2・第２シーズンでは、ジャン=リュック･ピカードと彼のクルーが新たな旅に出る。行き先は過去。ピカードは新旧両方の友人たちの協力を得て、銀河系の未来を救うため、２１世紀の地球の危機に立ち向かう。