En una conferencia entre líderes de medidas contra Kaii, el "Sistema Alice" de Shigemoto es rechazado por falta de resultados. Él emprende un nuevo proyecto, ambicioso pero peligroso, para demostrar sus capacidades, y cuestiona la dinámica de poder y las expectativas de la industria. Un individuo se acerca a Koshigaya con una propuesta sospechosa, poniendo a su padre en una situación delicada.

Kana y Koshigaya visitan el Instituto para exterminar una nueva especie de Kaii. Guiados por el subdirector Akasaka, se enfrentan a un espécimen Kaii desconcertante y aparentemente invencible que desafía toda lógica. Motivos ocultos relacionados con las regulaciones del poder mágico generan tensión cuando el Kaii muta. Con un plazo límite, las habilidades de Magilumiere se ponen a prueba.

Las Chicas Mágicas de Magilumiere y AST se enfrentan a una nueva especie de Kaii que causa estragos. Koshigaya le tiende la mano a Tsuchiba, lo que provoca un choque de opiniones que aumenta la tensión entre sus compañías. El Kaii desconocido muta rápidamente bajo la influencia del poder mágico, tras lo cual un individuo toma el control como operador para la inminente batalla de vida o muerte.

Una colaboración improvisada entre Magilumiere y AST se ve envuelta en una lucha a vida o muerte contra los Kaii de Clase C. Las cambiantes tácticas de Magilumiere trastocan los métodos convencionales, mientras Kana recopila datos en tiempo real durante la batalla para tomar el control. Mediante la fuerza física, el control y la guía, el equipo, aparentemente desequilibrado, idea un plan.

Magilumiere comienza a reclutar ingenieros para promocionar el Sistema Alice. Kana se esfuerza por transmitir el atractivo de la empresa mientras supervisa el proceso de entrevistas. Esto provoca la incorporación de personal inesperado, lo que aporta un nuevo aire al equipo. Cuando resulta difícil conseguir más talento para fortalecer su potencial de combate, Magilumiere va a Kioto.