12 Apen

27 jaar nadat een virus bijna de mensheid uitroeide, sturen wetenschappers een man (James Cole) terug naar het jaar 2015 om de uitbraak van de plaag te voorkomen.

Het spoor van een mysterieuze organisatie met de naam "het Leger van de 12 Monkeys" leidt Cole naar een psychiatrische instelling in 2015.

Een zoektocht naar de locatie van het virus leidt Cole naar het jaar 2014, een verschrikkelijk moment in het leven van dr. Railly vanwege een gevaarlijke uitbraak in Haïti.

Wanneer een gevaarlijke groep marauders die jaagt op Cole en Ramse een bedreiging voor de missie vormt door het verleden te redden, volgt een gevecht om het behoud van de toekomst.

Wanneer Cole en dr. Railly de confrontatie aangaan met het Leger van de 12 Monkeys ontdekken ze beiden de Nachtkamer.

Nadat de tragische gebeurtenissen in de Nachtkamer een vervangende werkelijkheid creëren in 2043, zet Cole zijn toekomst op het spel om dr. Railly te redden.

Cole, Railly en Aaron racen om te vermijden dat het virus wordt ingezet als biologisch wapen in Chechnya.

De kracht van de Kern die de tijdmachine van energie voorziet, neemt af.

Cole bevindt zich in het jaar 2017 tijdens de climax van de plaag.

De situatie bereikt een kritiek punt wanneer Ramse doet wat nodig is om zijn pasgevonden familie te beschermen, Cole met de onprettige gevolgen achterlatend.

Cole's laatste wanhopige poging om het Leger van de 12 Monkeys tegen te houden brengt hem naar Tokio in het jaar 1987.

Cole zal sterven door de gevolgen het tijdreizen. Railly moet de enige persoon vinden die hem zal kunnen redden.

In de finale van dit seizoen gaan Cole en Railly een laatste keer de confrontatie aan met hun meest naaste vijanden.