Stargate Atlantis

L'équipe est sauvée par l'arrivée du colonel Steven Caldwell à bord du Dédale, qui détruit deux vaisseaux Wraiths en approche. McKay espère que l'E2PZ leur sauvera la mise. Pendant ce temps, Ford agit bizarrement à la suite d'un accident.

Sheppard commence à se poser des questions quand d'étranges défaillances se produisent après leur retour de la Terre. Les membres de l'équipe découvrent que le Dédale a été infecté par un virus Wraith qui fait passer le vaisseau en mode survie.

La recherche du lieutenant Ford emmène Sheppard et Teyla sur la planète P3M-736 où ils sont capturés par Ronon Dex, un homme en fuite qui est chassé par les Wraiths. L'équipe offre son aide à Ronon, et ils affrontent à nouveau les Wraiths.

Sur la planète Thenora, l'équipe est choquée quand McKay et l'officier Laura Cadman sont téléportés dans un Dart Wraith. Quand l'équipe abat le vaisseau, ils découvrent qu'un bug technique a transféré la conscience de Cadman dans le corps de McKay.

L'équipe découvre une planète qui punit sévèrement ses criminels : ils sont mis près de la porte des étoiles pour être enlevés par les Wraiths. Cette coutume trop efficace force la société à mettre des innocents en prison pour apaiser les Wraiths.

L'équipe découvre les ruines d'une expérience des Anciens visant à créer le générateur d'énergie ultime, et McKay pense pouvoir finir ce que les Anciens avaient commencé. Teyla et Ronon découvrent que Ronon n'est pas le dernier de son peuple.

Beckett travaille sur un nouveau traitement qui pourrait rendre les Wraiths humains. L'équipe trouve une jeune Wraith qui pourrait être la première patiente de Beckett. Élevée par un humain, elle est impatiente, téméraire et prête à tout essayer.

Après avoir reçu le traitement anti-Wraith de Beckett, la vie de Sheppard est en danger : il se transforme lentement en hybride d'insecte Iratus. L'équipe se dépêche de trouver un remède, mais la solution repose peut-être sur Sheppard lui-même.

Sheppard (Joe Flanigan) et l'équipe découvrent un vaisseau de guerre Ancien appelé l'Aurore qui a survécu en animation suspendue. Sheppard y embarque via un environnement virtuel, espérant apprendre des informations vitales de la part des Anciens.

L'équipe est enlevée par le lieutenant Aiden Ford qui a recruté sa propre équipe de super soldats, des hommes qui ont pris de l'enzyme Wraith. L'équipe de Ford prévoit de détruire un vaisseau ruche pour démontrer le pouvoir incroyable de l'enzyme.

L'équipe est prise en otage par les Wraiths quand une tentative de détruire la ruche échoue. Sheppard se retrouve bientôt devant la reine Wraith, qui exige des réponses. McKay rentre à Atlantis et espère convaincre les gardes de secourir l'équipe.

L'équipe découvre un appareil créé par les Anciens qui aspire Sheppard sans prévenir. Alors que l'équipe tente de le libérer de l'étrange endroit où il est coincé, McKay découvre que le temps passe différemment à l'intérieur.

L'équipe a peu de temps pour empêcher les Goa'ulds de détruire Atlantis après que le général Landry les avertit qu'une bombe explosera s'ils essaient de se rendre sur Terre. Pendant ce temps, deux vaisseaux Wraiths se dirigent vers Atlantis.

En testant un jumper récemment réparé, McKay et le capitaine Hugh Griffin perdent soudain le contrôle du vaisseau et s'écrasent dans l'océan. Alors que le jumper commence à couler au fond de la mer, Griffin se sacrifie pour sauver McKay.

Sheppard et l'équipe découvrent un monde possédant la technologie créée par les Anciens. Mais la famille royale de la planète n'autorise personne d'autre qu'eux à l'utiliser et traite les villageois avec peu de dignité.

L'équipe découvre deux capsules de survie dans l'espace. Ils transfèrent accidentellement les esprits des occupants dans les corps de Sheppard et Weir. Les choses empirent quand ils découvrent que les deux individus veulent se détruire mutuellement.

L'équipe du colonel Sheppard est appelée d'urgence sur M1K-177, où l'équipe du major Lorne a été attaquée. Quand Sheppard et son unité arrivent, ils ne trouvent qu'un bâtiment brûlé contenant des corps calcinés : probablement Lorne et ses hommes.

Le lieutenant Kenmore se réveille amnésique à l'infirmerie. Il s'inquiète quand il commence à faire des cauchemars très réalistes où il est un Wraith. Ses peurs seraient infondées sans l'existence d'un sérum qui transforme les Wraiths en humains.

L'équipe de Sheppard visite la planète Taranis après l'invitation de deux dirigeants, le Dr Norina Pero et le chancelier Lycus, qui veulent que McKay répare un générateur de bouclier et un vaisseau dans une base des Anciens qu'ils ont découverte.

Kenmore revient sur Atlantis avec un groupe de Wraiths, en pleine guerre civile. Espérant utiliser sa connaissance d'Atlantis pour négocier avec Sheppard et l'équipe, il propose un échange : le sérum de Beckett contre la non-révélation d'Atlantis.