밀러와 홀든, 로시난테의 선원들은 가까스로 에로스 기지를 탈출하고 그 뒷일을 수습한다. 지구와 화성 간 쿠바 미사일 위기와 같은 위기가 고조되면서 화성 해병대 이등 중사 바비 드레이퍼와 그녀의 부대가 시리즈에 등장한다.

밀러와 홀든, 로시난테의 선원들은 프레드 존슨과 OPA 전투 부대원들의 도움을 받아 수상한 원시 분자 프로젝트에 대한 정보를 얻기 위해 위험한 급습을 계획한다. 지구에서는 애버사랄라가 프레드 존슨에 대한 중요한 사실을 알게 된다.

티코 기지로 돌아오면서 홀든과 밀러는 머리를 맞대고 급습을 어떻게 할 것인지에 대해 논의한다. 한편, 나오미와 앨릭스는 외상 후 스트레스 장애에 각자의 방식으로 대처한다. 홀든과 아모스는 한 냉담한 과학자를 신문한다. 애버사랄라는 내키지 않는 동맹을 하기 위해 적에게 손을 내민다.

밀러는 에로스 기지에 남아있는 원시 분자의 잔재를 완전히 없애기 위해 모르몬 세대의 거대한 우주선인 나우부를 훔치려는 절박하고도 위험한 계획을 생각해내고 홀든과 로시난테의 선원들, 프레드는 마지못해 이 계획에 동의한다. 한편, 애버사랄라는 원시 분자 프로젝트 배후의 인물을 알아낸다.

로시난테가 지구로 돌진하는 한 소행성 우주선을 쫓으면서 이것은 쫓고 쫓기는 시간 싸움이 되어버린다. 지구는 최악의 상황에 대비하는 한편, 애버사랄라는 홀든이 죽지 않고 살아있다는 사실에 놀라며 지구가 대재앙을 피하는 유일한 희망이 로시난테일지도 모른다는 생각을 한다.

지구와 화성은 소행성 충돌 이후 뒷수습을 하면서 해결방안을 찾는다. 애버사랄라는 줄스 피에르 마오와의 전쟁을 심각하게 고려한다. 로시난테의 선원들은 계속해서 원시 분자를 제거하는 임무를 수행한다. 나오미는 홀든이 자신과 의견을 달리하자 독자적인 행동에 나선다. 바비와 그녀의 화성 공격대가 가니메데 순찰팀에 합류하고 이들은 전혀 생각지 못했던 사건에 직면한다.

지구와 화성 간 평화회담 준비로 어린라이트 기지에는 긴장감이 감돈다. 가니메데에 대한 공격 이후 바비의 보고로 더욱 수상한 점이 밝혀진다. 앤더슨 도스는 티코로 들어오는 난민들의 행렬을 이용하여 프레드 존슨과 홀든이 유지하고 있는 불안한 동맹 관계를 와해하겠다고 협박한다.

나오미는 태양계의 전혀 예상치 못했던 곳에서 원시 분자의 흔적을 발견하고 프레드 존슨의 OPA에 대한 지배력은 붕괴하기 시작한다. 정신적 충격을 받은 가니메데 난민 한 명이 새로운 위협을 찾는 열쇠를 쥐고 있을지도 모른다.

홀든은 원시 분자와 그 배후 인물들을 찾아 전쟁 지역으로 잠입하기 위해 자신의 윤리적 기준을 넘는 행동을 한다. 바비는 지구와 화성 간 정치적 분쟁의 노리개로 전락하지만 애버사랄라는 회담의 결과와는 상관없이 자신이 인류의 적이 누구인지를 밝힐 수 있다는 것을 알게 된다.

홀든은 자신의 부하들을 이끌고 전쟁으로 황폐해진 가니메데의 기지를 찾아간다. 어린라이트와 에버사랄라는 격렬하게 대립하고 이는 그들의 관계를 영원히 바꿔놓는다. 바비는 자신의 적인 지구에 대한 자신의 근본적인 생각을 완전히 바꿔놓는 지구의 다른 면을 발견한다.

로시난테의 선원들이 끔찍한 것을 발견하게 되는데 이로 인해 이들은 자신들이 이해하지 못하는 어떤 것을 풀어주게 된다. 바비는 자신의 미래를 바꾸고 과거 또한 새롭게 하는 중대한 결심을 한다. 애버사랄라는 드디어 신출귀몰한 줄스 피에르 마오와 연락이 닿는다.

실험실에서 끔찍한 발견을 한 나오미와 홀든은 서로 헤어지게 되고 로시난테의 선원들은 서로를 적대시하게 된다. 애버사랄라와 바비는 인류의 운명이 불확실한 상태에서 위험한 만남을 갖고 이로 인해 이들은 전혀 예기치 못한 결과를 맞는다.

가까스로 탈출한 로시난테의 안도감도 잠시뿐, 선원들은 예기치 못한 적의 공격을 받고 우주선을 구하기 위해 사투를 벌인다. 애버사랄라는 적의 함정에 빠지고 도와줄 사람은 아무도 없다. 바비 드레이퍼만이 그녀를 구해줄 유일한 희망이다.