Alors que Taichi Yagami se prépare pour aller à son camp de vacances, une puissante cyberattaque frappe Tokyo et paralyse la ville. Sa mère et sa sœur cadette Hikari, parties pour Shibuya, sont bloquées sur la ligne circulaire de train qui est hors de contrôle : Taichi part les sauver mais il est soudainement transporté dans le Digimonde.
