MacGyver

W pierwszym odcinku trzeciego sezonu, trzy miesiące po odejściu z Fundacji Feniks i przeprowadzce do Nigerii, Mac musi odłożyć na bok nieporozumienie z ojcem. Okazuje się, że Jack staje się celem morderczego dyktatora, któremu już wcześniej nadepnął na odcisk i ekipa musi mu pomóc.

Jack dowiaduje się, że jego dawny kumpel z oddziału Delta został niesłusznie oskarżony o terroryzm w obcym kraju. MacGyver i Jack zbierają dawny oddział Delty i organizują niezatwierdzoną operację ratunkową.

MacGyver, Riley, Bozer i Leanna działają pod przykrywką na kampusie uniwersyteckim, żeby zdemaskować tajnego agenta, który rekrutuje studentów do międzynarodowych, zabójczych ataków. Jack łączy siły z łowcą głów Billym Coltonem (Lance Gross) w pościgu za zbiegiem, ale przeżywa niemiłe zaskoczenie, kiedy odkrywa, że Billy zaproponował Riley pracę.

MacGyver i Riley próbują przewieźć płynny tlen regionem okupowanym przez rebeliantów, tak by trafił do szpitala dziecięcego, zanim w placówce skończy się zapas. Pomaga im w tym zrozpaczony ojciec jednego z dzieci, Vasil (C. Thomas Howell). Riley zaś pomaga MacGyverowi zdecydować, czy powinien pozwolić ojcu wrócić do jego życia.

Góra próbuje porwać szefa kartelu narkotykowego, ale misja bardzo się komplikuje. MacGyver i Jack ruszają do Meksyku, żeby wydostać szefa, ścigając się przez samo serce kraju w trakcie Święta Zmarłych. Bozer i Riley wykorzystują Halloween jako pretekst, żeby zebrać informacje na temat człowieka oskarżonego o zdradę stanu.

Murdoc porywa Nashę (Sibongile Mlambo), dziewczynę MacGyvera. W ten sposób chce zmusić Maca, żeby ten odbił jego syna, Cassiana (Brady Bond), z rąk porywaczy. Niespodziewanie pojawia się niebezpieczna osoba z prywatnego życia Murdoca, która pozwala Macowi dowiedzieć się czegoś o przeszłości złoczyńcy.

Matty wysyła MacGyvera i ekipę do Ghany, żeby odzyskali twardy dysk z wysypiska śmieci elektronicznych, prowadzonego przez niebezpiecznego, władczego człowieka. Kiedy Matty nie chce zdradzić, co kryje się na dysku, prócz tajemniczego pliku o nazwie „Ważka”, ekipa zaczyna zastanawiać się, co może być dla niej aż tak ważne.

MacGyver z ekipą wyruszają w niebezpieczną misję, po tym jak irlandzki oficer wywiadu wyznaje, że wie, gdzie znajduje się „Duch”, śmiertelny twórca bomb, którego Mac próbuje schwytać od lat.

Kiedy fiolka ze śmiertelnym wirusem zostaje skradziona z CDC w Atlancie, MacGyver wraz z ekipą muszą jak najszybciej ją odzyskać, zanim złodziej spowoduje światową pandemię.

Matty zdradza ekipie szokujący sekret: ma męża, który od ośmiu lat działa pod przykrywką w organizacji przestępczej S-Kompania. Kiedy na jaw wychodzi jego praca w CIA, Matty zleca MacGyverowi odnalezienie męża, zanim będzie za późno.

Mac i Jack jadą na weekendowy odpoczynek do Las Vegas, jednak ich wyjazd przerywa pewna osoba z ich przeszłości, która porywa ich i zamyka w betonowym pokoju. Matty zleca Riley, Bozerowi i Leannie kradzież diamentu, na którym zakodowane są informacje o terrorystach. Kamień jest w rękach księżniczki w Mediolanie.

Feniks łączy siły z kobietą, która za dnia jest mamą na pełen etat, ale w nocy mistrzynią złodziejstwa. Razem spróbują złapać jej kontakt, przestępcę z półświatka, który zlecił jej kradzież brudnej bomby.

MacGyver zabiera Riley i Bozera na weekendowy trening survivalowy w dziczy, jednak sprawy przybierają niespodziewany obrót, kiedy trafiają na grupę agresywnych przestępców, poszukujących w terenie zagubionej skrzyni z pieniędzmi. Jack i Matty wybierają się w podróż, żeby umieścić byłego męża Matty i jego rodzinę w programie ochrony świadków.

Międzynarodowy boss mafijny składa Matty propozycję nie do odrzucenia – da się jej aresztować, jeśli będzie mógł wrócić do Stanów Zjednoczonych, żeby zobaczyć jak jego córka idzie do ołtarza. MacGyver i ekipa wchodzą na ślub bez zaproszenia, żeby upewnić się, że przestępca nie ucieknie, ale na miejscu okazuje się, że nie tylko oni czają się na uroczystości.

MacGyver i reszta ekipy ku swojemu zaskoczeniu poznają nową członkinię zespołu, Desi (Levy Tran). Tym razem muszą eskortować i chronić psa policyjnego, wykrywającego alkohol, tytoń i broń, którego ktoś chce zabić. Okazuje się, że nie tylko oni pojawiają się na miejscu zrzutu broni.

Feniks musi odzyskać ciało pilota, którego samolot rozbił się podczas testów systemu eksperymentalnego mapowania laserowego, który zaprojektował MacGyver. Riley próbuje zidentyfikować hakera, który podstępem skłonił jednostkę SWAT do aresztowania jej i Elwooda.

MacGyver i ekipa mają rozwiązać zagadkę zamkniętego pokoju, kiedy człowiek pracujący w zamkniętym, oddalonym, świetnie zabezpieczonym banku nasion znika bez śladu.

Kiedy Nicholas Helman (Michael Des Barres) pojawia się, żeby dokonać serii zabójstw, ekipa Feniksa jest zmuszona poprosić o pomoc osobę, która zna go najlepiej… jego protegowanego, Murdoca.

MacGyver i Desi pomagają grupie syryjskich uchodźców, których ścigają handlarze żywym towarem. W Los Angeles Bozer walczy o życie, uwięziony w samochodzie Góry, w którym podłożono bombę.

Kiedy dwójka amerykańskich turystów znika podczas „No-Go Challenge”, gry terenowej przebiegającej przez najniebezpieczniejsze kraje świata, zespół Feniksa wyrusza w podróż pod przykrywką, żeby znaleźć ich i zabrać do domu.

Były mąż Matty, Ethan (Brendan Hines), prosi ją o pomoc, kiedy S-Kompania, organizacja przestępcza, porywa jego żonę i córkę. Matty musi zdecydować, czy dokona zdrady stanu, żeby pomóc mu ratować rodzinę. Riley wyrusza wraz z Billym Coltonem (Lance Gross) oraz Mamą Colton (Sheryl Lee Ralph) na misję do Paryża i dokonuje wstrząsającego odkrycia.

W finale sezonu MacGyver staje do walki z nowym, przebiegłym przeciwnikiem. Szczegółowo dopracowane plany wroga stawiają Maca przed niemożliwym wyborem: może ocalić życie przyjaciela lub życie setek niewinnych osób. Ponadto Mac poznaje nowe informacje, które wbijają klin pomiędzy niego a ojca.