無限住人

江戶時代。凜身為町道場的女兒，為了替被殺的父母討回公道展開尋仇之旅。凜找來別名是百人斬，身為不死之身的萬次當她沿路的保鑣。她鎖定的尋仇對象是她極為憎恨的逸刀流統主天津影久。於是這場永生的男子和決定為報復而活的少女的旅程就此展開。

凜宣告在尋仇之旅上要去見父親的畫師朋友宗理。宗理表示無法幫上忙，但提供了資金給她。預算充足但是沒有線索的凜，在附近的鐵匠那裡發現父親被偷的劍。可是那把劍的持有者是逸刀流的劍客〝凶戴斗〞。

萬次在等待凜時，一名賣笑女上前攀談。萬次當下就識破她的圈套，不過仍配合她。但這個自稱為逸刀流劍客的女子乙橘槇繪實力似乎太弱。但在萬次放過她一馬後，槇繪再次現身時頭髮和眼睛都改變了。

凜想增強自己的實力，於是拜託萬次訓練她，不過她的實力仍遠遠比不上萬次，更別提要與逸刀流較量。心情低落的凜被聲音吸引，發現一個獨自在訓練的男子。凜心想〝總有一天也要變得像他一樣〞，凜看到那個男子的臉後大為吃驚。他正是宿敵逸刀流的統主，天津影久。

凜與影久邂逅不禁腿軟。凜左思右想理不清頭緒，此時一名和尚現身接近她和保鑣萬次。這名和尚自稱是逸刀流的〝閑馬永空〞。他與萬次比武，不過很快地就被萬次殺死。可是明明已死的閑馬竟然再次站了起來，傷口也已修復。原來閑馬與萬次同為不死之身。

凜前往觀賞祭典，遇到意氣風發的少年練造。萬次在面具屋與新夜發生衝突，劍拔弩張，此時新夜的兒子練造前來化解彼此的殺氣，隨後新夜和練造便離去了。凜在萬次背後觀看，不知為何用驚愕和憎惡的眼神持續關注新夜的身姿。

逸刀流被委託在幕府的講劍所任教，而商討該派誰出任指導師傅。他們的目標是使逸刀流的劍享譽世間。凶戴斗發誓要實現那個願景，不過他決定離開天津影久的身邊。與此同時，各地的逸刀流幹部開始被鎖定，連凶也不例外。

萬次和凜為了暗殺天津影久，找來四個無骸流的人，他們自稱有影久的情報。凜握有獨家情報，在遠離江戶的街道埋伏，她和屍良在影久逃亡時圍攻他。

偽一告訴凜影久的住處，不過凜和萬次成為無差別兇殺案的嫌犯。礙於嫌犯不能通過關口，可是多虧凜從前認識的女傭大展手段，她獨自前往一個村子，協助從關口偷渡。

萬次想追上凜，不過沒有通行證。此時宗理和凶出現在萬次面前。宗理告訴萬次他有辦法拿到無限多的通行證，可是有一個條件。另一方面，百琳和真理路再次推敲暗殺影久的計劃時，白髮獨臂的屍良現身。

萬次和凶因為彼此的目的不謀而合順勢同行，遭到禿頭的男人們襲擊。萬次因疼痛呻吟著，此時屍良從背後出現，砍下他的手臂。屍良對身體進行一番改造，期盼與萬次再次決鬥。可是凶擋在屍良眼前，因為屍良曾殺死對凶而言很重要的女人。

凜為了追捕影久前往加賀，碰巧被影久拯救。被心形唐流追殺的影久和凜一起行動，凜在途中開始對死敵影久另眼相看。

政府虐殺了逸刀流的成員。影久秘密聚集了剩下的逸刀流成員，發誓向政府報復。偽一邀請萬次加入無骸流，不過被他婉拒，雙方因而揮劍相殺。由於偽一武器壞掉而停戰，不過萬次決定去見無骸流的首領吐。

吐出招讓萬次被關在地牢。吐找來醫師綾目步蘭人，打算解開不死的謎。步蘭人以醫術發展之名對萬次的身體動刀。此時，凜在等萬次回來之際被捲入瞳阿和夷作奇怪的共同生活，他們在找住宿的地方。

步蘭人在人體實驗中將萬次的左腕成功移植到實驗對象出羽介身上。在此之後的實驗接連成功。可是吐對步蘭人施加壓力，想看到更多成果。吐使出刀刃逼近還未完成不死化的出羽介。凜在尋找萬次的途中遇到瞳阿和夷作。此時瞳阿撞倒的的官員上前。

在出羽介的事件後步蘭人接連失敗。最終被吐單獨監禁在禁閉室而發狂。但是因為那樣發狂錯亂，步蘭人從不死實驗中獲得重要的大事。人類基本上如同水獺。另一方面，凜和瞳阿為了救出被包圍的萬次救和夷作，決心侵入江戶城。

萬次和凜終於再次相會。可是以吐為首的強敵在地牢阻止凜和萬次逃出。此時瞳阿與原先認定已死的夷作現身幫忙。地牢開始崩壞。眼看就要逃出之際，意外的人物出現在凜和萬次面前。 並且，步蘭人從實驗結果得到的解答…。

吐因為江戶城的失敗而失去首領地位。儘管如此，為了殲滅逸刀流，他帶領六鬼團加以討伐。可是新首領英，認為逸刀流因為已放逐江戶，決定不加以責難。反之，為了確保吐不違反規定，選擇讓吐的妻小成為人質。

吐率領六鬼團追殺逸刀流。凜和萬次聽聞後決定加入追殺逸刀流的行列。不論誰離開江戶，追殺逸刀流，以天津影久為首的四人幹部都不見蹤影。然後在深夜時分，影久等四人站在江戶城的大手門前。

凜和萬次追趕著影久，不過他們被屍良襲擊，凜被擄走。萬次為了救她，不僅見到屍良，還與練造再次相見。萬次為了幫助凜與屍良搏鬥。可是不可思議的是劃傷萬次的竟然是屍良應該已不見的左腕。

萬次與屍良在生死搏鬥後負傷入睡。練造拿刀打算趁機殺了萬次，不過被凜等人勸退。與此同時，吐知道江戶城遇襲後大為憤怒。在缺乏領導者下，吐仍持續追殺逸刀流。結果逸刀流的一員進入山中的村落。吐的女兒燎為了幫助父親，試圖征服他。

六鬼團的荒篠、八宗、叢咲作為先鋒與逸刀流發生劇烈衝突。不過重要的阿葉山被門生們被放跑。另一方面，硬被放跑的阿葉山與替吐效力的偽一、百琳對峙。

逸刀流、六鬼團，以及萬次和凜彷彿被引導般地集結在那珂湊。各方將動機施加在劍上，開始最後的相互扼殺。欺騙、鎮壓、亂舞。頂尖高手間的最後決戰火花四射。最後獲勝的是…。

集聚一堂的人們一個接一個喪命。剩下的人們也已滿身創傷。儘管如此他們還是拿起劍，秉持信念互相揮劍。最後獲勝的人是…而完成報仇的又是…。永生的男人，與燃燒有限生命的人們的故事在這裡閉幕。