「ナイトメアー･ビフォア･クリスマス」のヘンリー･セリック監督が、ニール･ゲイマンのベストセラー児童文学を映画化した壮大なストップモーション･アニメ。退屈な毎日を送っていたコラライン・ジョーンズ（ダコタ･ファニング）はある日、秘密の扉を発見。通り抜けた先には、現実にそっくりだが、より素晴らしい世界があった。しかし完璧だと思われた世界が一変し、コララインは別のママ（テリー･ハッチャー）たちに捕らわれそうになる。

ゴーストフェイスが再び現れる。今度の標的はシドニーの娘だ。